The evolution of polar fish hemoglobin: a phylogenetic analysis of the ancestral amino acid residues linked to the Root effect. (Articolo in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Articolo in rivista (Classe)

Label

• The evolution of polar fish hemoglobin: a phylogenetic analysis of the ancestral amino acid residues linked to the Root effect. (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2003-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Alternative label

• Verde C., Parisi E., di Prisco G. (2003)
  The evolution of polar fish hemoglobin: a phylogenetic analysis of the ancestral amino acid residues linked to the Root effect.
  in Journal of molecular evolution
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Verde C., Parisi E., di Prisco G. (literal)

Pagina inizio

• S257 (literal)

Pagina fine

• S267 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#altreInformazioni

• L'intero Progetto di Evoluzione dei meccanismi di adattamento alle basse temperature nell’Oceano del Nord e nell’Oceano del Sud si integra in due programmi internazionali, patrocinati dallo SCAR nella sua rinnovata struttura: (1) Coastal/Shelf Ecology of the Antarctic Sea Ice Zone (EASIZ), 1994-2004. (2) Evolutionary Biology of Antarctic Organisms, (EVOLANTA), 2001-2008. Il carattere multinazionale del Progetto è rafforzato dalla rete di collaborazioni con istituzioni prestigiose, tra cui: Prof. H.W Detrich III, Northeastern Univ, Boston, MA, USA; Dr. C. Ozouf-Costaz, Museum National d’Histoire Naturelle, Paris, France. Impact Factor 4.011 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 57 (literal)

Rivista

• Journal of molecular evolution (Rivista)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#descrizioneSinteticaDelProdotto

• Lo studio dell'evoluzione molecolare comprende l'evoluzione di DNA e proteine e la storia evolutiva dei geni e degli organismi, aspetti intimamente correlati e cruciali per stabilire le relazioni filetiche tra taxa differenti. Gli avanzamenti compiuti nel settore del sequenziamento di DNA e proteine, unitamente allo sviluppo di computer ad alta capacità di calcolo, consentono di effettuare studi sofisticati sui meccanismi dell'evoluzione. In questo lavoro è stata studiata l'evoluzione dei pesci polari in relazione all'adattamento all'ambiente. La piattaforma continentale antartica presenta una limitata biodiversità: la fauna ittica è costituita principalmente da Nototenioidei, un gruppo di pesci perfettamente adattati al freddo e altamente stenotermi, che ha particolari meccanismi fisiologici e biochimici. L’analisi filogenetica della sequenza in aminoacidi delle emoglobine da pesci artici ha dimostrato che alcune catene di queste specie occupano una posizione intermedia tra i Nototenioidei antartici e i pesci temperati mentre altri geni della catena sono compresi nel clade dei Nototenioidei antartici. È stato dimostrato che i residui aminoacidici coinvolti nell’effetto Root possono essere considerati caratteri ancestrali e che la perdita di questa proprietà è un adattamento fisiologico alle basse temperature. (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

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• CNR (literal)

Titolo

• The evolution of polar fish hemoglobin: a phylogenetic analysis of the ancestral amino acid residues linked to the Root effect. (literal)

Abstract

• Originating from a benthic ancestor, the suborder Notothenioidei (the dominant fish fauna component of the Antarctic sea) underwent a remarkable radiation, which led notothenioids to fill several niches. The ecological importance of notothenioids in Antarctica and their biochemical adaptations have prompted great efforts to study their physiology and phylogeny, with special attention to the evolutionary adaptation of the oxygen-transport system. We herewith report the evolutionary history of alpha- and beta-globins under the assumption of the molecular clock hypothesis as a basis for reconstructing the phylogenetic relationships among species. These studies have been extended to fish species of other latitudes, including the Arctic region. The northern and southern polar oceans have very different characteristics; indeed, in many respects the Antarctic and Arctic ichthyofaunas are more dissimilar than similar. Our results show that the inferred phylogeny of Arctic and Antarctic globins is different. Taking advantage of the wealth of information collected on structure and function of hemoglobins, we have attempted to investigate the evolutionary history of an important physiological feature in fish, the Root effect. The results suggest that the amino acid residues reported to play a key role in the Root effect may be regarded as ancestor characters, but the lack of this effect in extant species can hardly be associated with the presence of synapomorphies. (literal)

Prodotto di

• Institute of protein biochemistry (IBP) (Istituto)

Autore CNR

• VINCENZA VERDE (Unità di personale interno)
• ELIO PARISI (Persona)
• GUIDO DI PRISCO (Unità di personale interno)

Insieme di parole chiave

• Keywords of "The evolution of polar fish hemoglobin: a phylogenetic analysis of the ancestral amino acid residues linked to the Root effect." (Insieme di parole chiave)

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• Institute of protein biochemistry (IBP) (Istituto)

Autore CNR di

• VINCENZA VERDE (Unità di personale interno)
• GUIDO DI PRISCO (Unità di personale interno)
• ELIO PARISI (Persona)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Journal of molecular evolution (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Keywords of "The evolution of polar fish hemoglobin: a phylogenetic analysis of the ancestral amino acid residues linked to the Root effect." (Insieme di parole chiave)