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A novel member of the Bacterial-Archaeal regulator family is a non-specific DNA binding protein and induces positive supercoiling (Articolo in rivista)

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A novel member of the Bacterial-Archaeal regulator family is a non-specific DNA binding protein and induces positive supercoiling (Articolo in rivista) (literal)

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Napoli A.1, Kvaratskelia M.2, White M.F.2, Rossi M.1, Ciaramella M.1 (2001)
A novel member of the Bacterial-Archaeal regulator family is a non-specific DNA binding protein and induces positive supercoiling
in Journal of biological chemistry (Online)
(literal)

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Il lavoro è stato svolto in collaborazione con il gruppo del Prof. M: White (St Andrews) uno dei migliori gruppi a livello internazionale allavanguardia nella biochimica e biofisica. Journal of Biological Chemistry è uno dei più prestigiosi giornali di biochimica e biologia molecolare e cellulare, con una vastissima audience Impact Factor 7.258. (literal)

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Rivista

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Il lavoro presenta lidentificazione, purificazione e caratterizzazione biochimica della proteina Smj12 dellarcheobatterio termoacidofilo Sulfolobus solfataricus. Smj12 lega il DNA in maniera non specifica e induce superavvolgimenti positivi del DNA. La regolazione della conformazione del DNA svolge un ruolo fondamentale in processi essenziali quali il controllo dell'espressione genica, la condensazione del DNA, la decatenazione e segregazione delle molecole di DNA neoreplicate, e nella ricombinazione. Poiché le alte temperature inducono danni chimici e denaturazione del DNA, ed inoltre ne perturbano la conformazione, si suppone che nei microorganismi ipertermofili meccanismi peculiari assicurino al materiale genetico la necessaria stabilità strutturale, consentendone al tempo stesso lattività. Mentre nei mesofili il DNA è negativamente superavvolto in vivo, negli ipertermofili è rilassato o positivamente superavvolto. Smj12, la prima e a tuttoggi unica, proteina in grado di indurre superavvolgimenti positivi in Archea, potrebbe essere coinvolta nella regolazione della superelicità del DNA durante uno più processi metabolici quali ricombinazione, riparazione o replicazione. (literal)

Note

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Titolo

A novel member of the Bacterial-Archaeal regulator family is a non-specific DNA binding protein and induces positive supercoiling (literal)

Abstract

In hyperthermophilic Archaea genomic DNA is from relaxed to positively supercoiled in vivo because of the action of the enzyme reverse gyrase, and this peculiarity is believed to be related to stabilization of DNA against denaturation. We report the identification and characterization of Smj12, a novel protein of Sulfolobus solfataricus, which is homologous to members of the so-called Bacterial-Archaeal family of regulators, found in multiple copies in Eubacteria and Archaea. Whereas other members of the family are sequence-specific DNA- binding proteins and have been implicated in transcriptional regulation, Smj12 is a nonspecific DNA-binding protein that stabilizes the double helix and induces positive supercoiling. Smj12 is not abundant, suggesting that it is not a general architectural protein, but rather has a specialized function and/or localization. Smj12 is the first protein with the described features identified in Archaea and might participate in control of superhelicity during DNA transactions. (literal)

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