Testing and evaluation of microarray image analysis software (Contributo in atti di convegno)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Contributo in atti di convegno (Classe)

Label

• Testing and evaluation of microarray image analysis software (Contributo in atti di convegno) (literal)

Anno

• 2008-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Alternative label

• Infantino Ignazio, Lodato Carmelo, Lopes Salvatore (2008)
  Testing and evaluation of microarray image analysis software
  in The Second International Conference on Complex, Intelligent and Software Intensive Systems, University of Catalonia, Spain, 4-7 March 2008
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Infantino Ignazio, Lodato Carmelo, Lopes Salvatore (literal)

Pagina inizio

• 655 (literal)

Pagina fine

• 660 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#url

• http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=4606749&tag=1 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#titoloVolume

• CISIS 2008, The Second International Conference on Complex, Intelligent and Software Intensive Systems (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• Istituto di Calcolo e Reti ad Alte Prestazioni ICAR, Consiglio Nazionale delle Ricerche CNR, Viale delle Scienze, edif. 11, 90128, Palermo (PA), Italy (literal)

Titolo

• Testing and evaluation of microarray image analysis software (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#isbn

• 0-7695-3109-1 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#curatoriVolume

• Fatos Xhafa, Leonard Barolli (literal)

Abstract

• The paper describes a novel approach to the microarray image simulation in order to provide researchers with a tool for testing and evaluating the performance of analysis software. Characteristics of a given microarray experiment are captured from public databases. Extracted data are then used for generating a synthetic microarray image and the corresponding ground truth data (i.e. the gene expression values). Given a particular experiment, and/or a specific hardware, and/or a software tool for microarray image analysis and so on, we use raw data obtained in identical or similar conditions to model simulated images with known values of gene activation. Hence, using the simulated images as benchmark, one can estimate expected errors and choose the most suitable analysis software for the real experiment. (literal)

Editore

• IEEE Computer Society (Editore)

Prodotto di

• Metodologie e tecniche ICT per l'e-health (INT.P02.014.001) (Modulo)
• Istituto di calcolo e reti ad alte prestazioni (ICAR) (Istituto)
• Analisi intelligente dei dati per la bioinformatica (INT.P02.007.001) (Modulo)

Autore CNR

• CARMELO LODATO (Unità di personale interno)
• IGNAZIO INFANTINO (Unità di personale interno)
• SALVATORE LOPES (Unità di personale interno)

Incoming links:

Prodotto

• Istituto di calcolo e reti ad alte prestazioni (ICAR) (Istituto)
• Metodologie e tecniche ICT per l'e-health (INT.P02.014.001) (Modulo)
• Analisi intelligente dei dati per la bioinformatica (INT.P02.007.001) (Modulo)

Autore CNR di

• SALVATORE LOPES (Unità di personale interno)
• IGNAZIO INFANTINO (Unità di personale interno)
• CARMELO LODATO (Unità di personale interno)

Editore di

• IEEE Computer Society (Editore)