UTRdb and UTRsite: a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs. (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• UTRdb and UTRsite: a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs. (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2005-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Alternative label

• Mignone F.; Grillo G.; Licciulli F.; Iacono M.; Liuni S.; Kersey P.J.; Duarte J.; Saccone C.; Pesole G. (2005)
  UTRdb and UTRsite: a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs.
  in Nucleic acids research
  (literal)

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• Mignone F.; Grillo G.; Licciulli F.; Iacono M.; Liuni S.; Kersey P.J.; Duarte J.; Saccone C.; Pesole G. (literal)

Pagina inizio

• D141 (literal)

Pagina fine

• D146 (literal)

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• All internet resources implemented for retrieval and functional analysis of 50 and 30 untranslated regions of eukaryotic mRNAs are accessible at http://www.ba.itb.cnr.it/UTR/ (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 33 (literal)

Rivista

• Nucleic acids research (Rivista)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroFascicolo

• S1 (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• Istituto di Tecnologie Biomediche,CNR-Sede di Bari Dipartimento di Scienze Biomolecolari e Biotecnologiche, Università di Milano Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Università di Bari EMBL Outstation, The European Bioinformatics Institute,Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton,Cambridgeshire (literal)

Titolo

• UTRdb and UTRsite: a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs. (literal)

Abstract

• The 5' and 3' untranslated regions of eukaryotic mRNAs play crucial roles in the post-transcriptional regulation of gene expression through the modulation of nucleo-cytoplasmic mRNA transport, translation efficiency, subcellular localization and message stability. UTRdb is a curated database of 5' and 3' untranslated sequences of eukaryotic mRNAs, derived from several sources of primary data. Experimentally validated functional motifs are annotated (and also collated as the UTRsite database) and cross-links to genomic and protein data are provided. The integration of UTRdb with genomic and protein data has allowed the implementation of a powerful retrieval resource for the selection and extraction of UTR subsets based on their genomic coordinates and/or features of the protein encoded by the relevant mRNA (e.g. GO term, PFAM domain, etc.). (literal)

Prodotto di

• Bioinformatica per la Genomica Funzionale e Comparata (SV.P18.004.001) (Modulo)

Autore CNR

• CECILIA SACCONE (Unità di personale esterno)
• VITO FLAVIO LICCIULLI (Unità di personale interno)
• GIORGIO GRILLO (Unità di personale interno)
• SABINO LIUNI (Persona)

Insieme di parole chiave

• Keywords of "UTRdb and UTRsite: a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs." (Insieme di parole chiave)

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Autore CNR di

• VITO FLAVIO LICCIULLI (Unità di personale interno)
• GIORGIO GRILLO (Unità di personale interno)
• SABINO LIUNI (Persona)
• CECILIA SACCONE (Unità di personale esterno)

Prodotto

• Bioinformatica per la Genomica Funzionale e Comparata (SV.P18.004.001) (Modulo)

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• Nucleic acids research (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Keywords of "UTRdb and UTRsite: a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs." (Insieme di parole chiave)