CpG islands under selective pressure are enriched with H3K4me3, H3K27ac and H3K36me3 histone modifications. (Articolo in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Articolo in rivista (Classe)

Label

• CpG islands under selective pressure are enriched with H3K4me3, H3K27ac and H3K36me3 histone modifications. (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2013-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1186/1471-2148-13-145 (literal)

Alternative label

• Akhtar MM, Scala G, Cocozza S, Miele G, Monticelli A. (2013)
  CpG islands under selective pressure are enriched with H3K4me3, H3K27ac and H3K36me3 histone modifications.
  in BMC evolutionary biology (Online)
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Akhtar MM, Scala G, Cocozza S, Miele G, Monticelli A. (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 13 (literal)

Rivista

• BMC evolutionary biology (Rivista)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroFascicolo

• 145 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• \"Gruppo Interdipartimentale di Bioinformatica e Biologia Computazionale, Università di Napoli \"Federico II\" - Università di Salerno, Naples, Italy Dipartimento di Fisica, Università degli Studi di Napoli \"Federico II\", Naples, Italy Istituto Nazionale di Fisica Nucleare - Sezione di Napoli, Naples, Italy Dipartimento di Medicina Molecolare e Biotecnologie Mediche, Università degli Studi di Napoli \"Federico II\", Naples, Italy CNR, Istituto di Endocrinologia ed Oncologia Sperimentale IEOS, Naples, Italy (literal)

Titolo

• CpG islands under selective pressure are enriched with H3K4me3, H3K27ac and H3K36me3 histone modifications. (literal)

Abstract

• In this paper, we have studied, using a computational biology approach, the relationship between histone modifications in CGIs and selective pressure in Homo sapiens. We considered three histone modifications: histone H3 lysine 4 trimethylation (H3K4me3), histone H3 lysine 27 acetylation (H3K27ac) and histone H3 lysine 36 trimethylation (H3K36me3), and we used the publicly available genomic-scale histone modification data of thirteen human cell lines. To define regions under selective pressure, we used three distinct signatures that mark selective events from different evolutionary periods. We found that CGIs under selective pressure showed significant enrichments for histone modifications. (literal)

Prodotto di

• Institute Experimental Endocrinology and Oncology \"Gaetano Salvatore\" (IEOS) (Istituto)
• Studio dell'espressione e della funzione di geni e proteine coinvolte nel diabete di tipo 2 (SV.P16.001.002) (Modulo)

Autore CNR

• ANTONELLA MONTICELLI (Unità di personale interno)

Incoming links:

Autore CNR di

• ANTONELLA MONTICELLI (Unità di personale interno)

Prodotto

• Institute Experimental Endocrinology and Oncology \"Gaetano Salvatore\" (IEOS) (Istituto)
• Studio dell'espressione e della funzione di geni e proteine coinvolte nel diabete di tipo 2 (SV.P16.001.002) (Modulo)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• BMC evolutionary biology (Rivista)