Ab initio detection of fuzzy amino acid tandem repeats in protein sequences (Articolo in rivista)

Type
Label
  • Ab initio detection of fuzzy amino acid tandem repeats in protein sequences (Articolo in rivista) (literal)
Anno
  • 2012-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
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  • 10.1186/1471-2105-13-S3-S8 (literal)
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  • Pellegrini Marco, Renda Elena, Vecchio Alessio (2012)
    Ab initio detection of fuzzy amino acid tandem repeats in protein sequences
    in BMC bioinformatics; Biomed Central Ltd., London (Regno Unito)
    (literal)
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  • Pellegrini Marco, Renda Elena, Vecchio Alessio (literal)
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  • ID_PUMA: cnr.iit/2012-A0-001 (literal)
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  • 13 (literal)
Rivista
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  • 13 (literal)
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  • S3 (literal)
Note
  • ISI Web of Science (WOS) (literal)
  • Scopu (literal)
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  • CNR-IIT, Pisa, Italy; CNR-IIT, Pisa, Italy; Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione, Università di Pisa, Italy (literal)
Titolo
  • Ab initio detection of fuzzy amino acid tandem repeats in protein sequences (literal)
Abstract
  • Tandem repetitions within protein amino acid sequences often correspond to regular secondary structures and form multi-repeat 3D assemblies of varied size and function. Developing internal repetitions is one of the evolutionary mechanisms that proteins employ to adapt their structure and function under evolutionary pressure. While there is keen interest in understanding such phenomena, detection of repeating structures based only on sequence analysis is considered an arduous task, since structure and function is often preserved even under considerable sequence divergence (fuzzy tandem repeats). (literal)
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