Descrizione del modulo "Studi proteomici e metabolomici per la caratterizzazione e selezione di varietà e genotipi di pomodoro (AG.P01.012.004)"

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  • Descrizione del modulo "Studi proteomici e metabolomici per la caratterizzazione e selezione di varietà e genotipi di pomodoro (AG.P01.012.004)" (literal)
Potenziale impiego per bisogni individuali e collettivi
  • Le tematiche svolte nell'ambito di questo di questo modulo sono relativi alla ricerca di base e volte ad una maggiore comprensione dei meccanismi molecolari alla base dei processi di adattamento e di tolleranza della pianta di pomodoro alle alte temperature e delle basi genetiche che regolano la biosintesi dei polifenoli. (literal)
Tematiche di ricerca
  • Le principali tematiche di ricerca sono di seguito riportate: - studio dei meccanismi molecolari alla base dei processi di adattamento e di tolleranza della pianta di pomodoro alle alte temperature integrando approcci proteomici e metabolomici; - analisi quali-quantitativa della frazione polifenolica estratta da mesocarpo di una popolazione di linee di introgressione (IL) di Solanum pennellii in S. lycopersicum cv. M82 in cui singoli segmenti di cromosoma selvatico sono inseriti in condizione di omozigosi nel contesto genomico della specie coltivata. (literal)
Competenze
  • Spettrometria di massa, Chimica Analitica e Biochimica (literal)
Potenziale impiego per processi produttivi
  • Le tematiche svolte nell'ambito di questo modulo sono relativi alla ricerca di base e volte ad una maggiore comprensione dei meccanismi molecolari alla base dei processi di adattamento e di tolleranza della pianta di pomodoro alle alte temperature e delle basi genetiche che regolano la biosintesi dei polifenoli. Va comunque sottolineato che i nostri risultati, integrati da quelli ottenuti dalle altre Unità operanti nell'ambito del progetto Genopom, permetteranno di selezionare varietà di pomodoro con specifiche caratteristiche di interesse agronomico(ad esempio maggiore tolleranza a stress termici, idrici, etc.) (literal)
Obiettivi
  • L'obiettivo di questo modulo rientra in quello più generale della commessa e prevede la Realizzazione di un Laboratorio di Genomica per l'innovazione e la valorizzazione della filiera del pomodoro (GenoPOM), a Portici, finalizzato allo sviluppo di processi e prodotti che permettano di rilanciare, innovare, rendere competitivo il comparto pomodoro italiano a livello nazionale e internazionale. Ciò verrà realizzato attraverso lo sviluppo di piattaforme tecnologiche pre-competitive e competitive, basate sulla genomica e su tecnologie associate (metabolomica, proteomica, trascrittomica e bioinformatica). In particolare gli obiettivi del modulo saranno i seguenti: - studio dei meccanismi molecolari alla base dei processi di adattamento e di tolleranza della pianta di pomodoro alle alte temperature integrando approcci proteomici e metabolomici; - analisi quali-quantitativa della frazione polifenolica estratta da mesocarpo di una popolazione di linee di introgressione (IL) di Solanum pennellii in S. lycopersicum cv. M82 in cui singoli segmenti di cromosoma selvatico sono inseriti in condizione di omozigosi nel contesto genomico della specie coltivata. (literal)
Stato dell'arte
  • Negli ultimi anni sono stati intrapresi studi per il sequenziamento del genoma di molti organismi vegetali di rilevante interesse tecnologico e nutrizionale. Questi studi hanno di fatto fornito le informazioni necessarie per l'avvio di studi proteomici nel campo della biologia vegetale, volti, ad esempio, a studiare alterazioni nel profilo delle proteine espresse da un determinato organismo sottoposto a stress biotici e abiotici. Il passaggio successivo essenziale è, naturalmente, rappresentato dallo studio del metaboloma, disciplina che studia i metaboliti presenti nella cellula, in un particolare stato fisiologico o patologico, le differenti vie metaboliche attraverso cui questi si originano e, di conseguenza, le interazioni che tra di esse avvengono. E' importante sottolineare che sia in studi proteomici che metabolomici, la spettrometria di massa gioca un ruolo centrale, grazie soprattutto a recenti sviluppi strumentali che consentono analisi estremamente sensibili e rapide. (literal)
Tecniche di indagine
  • Metodologie elettroforetiche e cromatografiche. Metodologie di spettrometria di massa Metodi di biochimica e chimica analitica (literal)
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