Descrizione previsione attività della commessa "Applicazioni innovative di enzimi e biotrasformazioni (AG.P01.028)"

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  • Descrizione previsione attività della commessa "Applicazioni innovative di enzimi e biotrasformazioni (AG.P01.028)" (literal)
Iniziative per acquisizione entrate
  • Progetti ammessi ed in attesa di finanziamento: -Titolo del progetto \"Materiali innovativi per un'agricoltura sostenibile, il risparmio energetico e la salvaguardia dell'ambiente\" – M. A. RE. A) PON II (Programma Operativo Nazionale Ricerca e Competitività-Aggregazione pubblico privata per le applicazioni industriali. EURO: 25.000 -Titolo del progetto: Rete integrata per le biotecnologie applicate a molecole ad attività farmacologica –FARMABIONET. Responsabile di Research Unit: Gianna Palmieri Ente finanziatore: REGIONE CAMPANIA POR FESR 2007/2013 O.O. 2.1 EURO: 30.000,00 -Titolo del progetto: Inibitori di proteasi archaeali appartenenti alla famiglia delle PEBP. Legge n. 5 del 28/03/2002 (Regione Campania) – Bando 2007 Responsabile: Gianna Palmieri Ente finanziatore: REGIONE CAMPANIA, ammesso a finanziamento e in attesa di piano esecutivo. EURO: 10.000,00. -Titolo del progetto \"Trasferimento Tecnologico e integrazione di Biotecnologie per la Salute, l'Alimentazione e l'Ambiente – BioTTasa\" – Bando RIDITT. (GU n. 19 25/01/2010) Ente finanziatore: Ministero dello Sviluppo Economico -Titolo del progetto \"Role of Acylpeptide Hydrolase in synaptic function during the ontogeny of Sprague-dawley rats. Involvement of endogenous beta-Amyloid peptide levels and ±7 nicotinic receptors in this mechanisms. 2014 Regular Competition National fund for Scientific & technological development (FONDECYT) Santiago-Chile EURO: 10.000,00. -Titolo del progetto \"Dalla Ricerca alle Applicazioni Spaziali e Cliniche: verifica dell'efficacia di molecole citoprotettive, antiossidanti e radioprotettrici, per facilitarne trasferimentotecnologico\" (RASC)\" Ente finanziatore: Agenzia Spaziale Italiana Finanziamneto previsto € 60.000 Saranno inoltre Presentati progetti Horizon 2020 (literal)
Punti critici
  • Lo svolgimento delle attività della commessa nello scorso anno è stato negativamente condizionato dalle difficoltà dovute al passaggio del personale e delle attività di ricerca dal DSB al DiSBA e alla creazione ex-novo dell'IBBR. Inoltre gravi disagi sono dovuti al sottodimensionamento dell' amministrazione della UOS di Napoli, cosa che ha penalizzato l'attività della commessa rallentando gli acquisti, le rendicontazioni, l'accertamento fondi e tutte le pratiche amministrative in generale. E'auspicabile che al piu' presto l'amministrazione centrale provveda ad integrare il personale addetto all'amministrazione della UOS di Napoli dell'IBBR. Si auspica inoltre un piano pluriennale di assunzioni di personale a tempo determinato e indeterminato e l'istituzione di un fondo per dottorati di ricerca gestiti direttamente dall'ente. E' auspicabile l'acquisizione di finanziamenti da parte dell'Ente (literal)
Attività da svolgere
  • Questa commessa è migrata dal Dipatimento di Scienze della Vita (SV.P14.014) - Nell'ambito delle linea di ricerca sulla stabilità genomica, proseguiranno gli studi funzionali e strutturali delle DNA-alchil-trasferasi da organizmi termofili (Sulfolobus solfataricus e Thermus thermophilus) e mesofili (Mycobacterium tubercolosis e Caenhorabditis elegans). Saranno identificate e caratterizzate proteine coinvolte nella riparazione del DNA in S. solfataricus e analizzate le reciproche interazioni strutturali e funzionali. Topoisomerasi termofile e mesofile in soluzione e immobilizzate su membrane nanoporose saranno utilizzate per la produzione di isomeri topologici di DNA da studiare al microscopio a forza atomica e in esperimenti di dinamica molecolare e come substrati per varie reazioni enzimatiche (progetto FIRB-Futuro in ricerca). Si tenteranno nuove strategie per la espressione eterologa e purificazione delle proteine FancD2 e FancI di C. elegans e loro domini funzionali. Le proteine purificate verranno sottoposte ad analisi struttura-funzione compatibili con le rispettive rese. Saranno identificati nuovi interattori di FancD2 umano e di C. elegans (progetti Telethon e AIRC). Sarà studiato il ruolo nella citoprotezione da radiazioni ionizzanti di composti chimici in grado di attivare le heat shock proteins in cellule e in tessuti di topo (progetto Agenzia Spaziale Italiana). - Nell'ambito degli studi di glicobiologia, saranno messe a punto le condizioni di reazione della thioglycoligasi da Clostridium perfrigens e analizzati campioni proteici da utilizzare per esperimenti di spettrometria di massa (progetto MERIT Nuovi Network Molecolari). - Saranno immobilizzate anidrasi carboniche (CA) innovative identificate nel genoma di batteri termofili su opportuni supporti da impiegare nella realizzazione di bioreattori per la cattura biomimetica della CO2 presente nei fumi di combustione. Saranno studiate le proprietà funzionali e strutturali della CA identificata nel genoma del batterio termofilo Sulfurihydrogenibium azorense. Saranno studiate le proprietà biochimiche di una RubisCO termostabile, la quale, insieme alle CA, è l'enzima chiave nella fissazione del carbonio. Inoltre, saranno studiate le proprietà cinetiche e chimico-fisiche di una fosfoenolpiruvato carbossilasi (PEPC) termostabile da utilizzare insieme alla CA nella conversione del piruvato in acido ossalacetico (progetti PON03_00157_1 e PNRA-Programma Nazionale di Ricerche in Antartide). - Il programma di ricerca sui sistemi enzimatici coinvolti nelle difese antiossidanti in organismi adattati al freddo procederà indagando il ruolo del Proteasoma nei pesci Antartici, saranno approfonditi gli studi sulle APEH in specie marine antartiche focalizzando l'attenzione su una possibile cooperazione/correlazione APEH - Proteasoma. L'analisi dell'attività dell'APEH purificata da eritrociti umani verso substrati ossidati verrà valutata a carico di peptidi sintetici e proteine ossidate e non al fine di indagare sulla specificità e meccanismo di riconoscimento. Si studieranno gli effetti dell'inibizione dell'APEH sui processi di plasticità sinaptica e di 'learning memory' a livello del sistema nervoso centrale in modelli murini attraverso tecniche di analisi ex-vivo ed in vivo. Tale sperimentazione verrà effettuata attraverso l'impiego delle molecole naturali e di sintesi isolate nel nostro gruppo. Inoltre sarà effettuato lo studio dell'attività anti-proliferativa del nuovo inibitore dell'APEH identificato, in cellule tumorali di osteosarcoma, investigando il coinvolgimento del sistema ubiquitina-proteasoma nei meccanismi di morte cellulare (progetto MERIT Oncologia). - Gli studi proteomici proseguiranno con la quantificazione dinamica mediante SILAC delle fosfoproteine differenzialmente espresse in cellule muscolo scheletale L6 (ratto) trasfettate con il fattore di trascrizione Prep1 in seguito a stimolazione con insulina (progetto MERIT Nuovi Network Molecolari). Sarà messo a punto un metodo per l'isolamento di vescicole extracellulari (Evs) da piante e saranno quantificate le proteine nucleari isolate da cellule HL60 in seguito a trattamento con il chemioterapico daunomicina e suoi derivati coniugati con peptidi (progetto CNR-MTA). - Per quanto riguarda le ricerche sull'idrolisi enzimatica delle biomasse, nel corso del 2015 saranno prese in considerazione altre biomasse lignocellulosiche e saranno valutati ulteriori metodi di pretrattamento alternativi. L'impiego dei biocatalizzatori verrà realizzato tramite la messa a punto di adeguati disegni sperimentali delle prove di biotrasformazione in cui essi verranno utilizzati. (literal)
Risultati attesi
  • - Informazioni sulle proprietà funzionali e strutturali di proteine coinvolte nella riparazione del DNA e di proteine che inducono modifiche strutturali del DNA in organismi mesofili e termofili. - Purificazione delle proteine FancD2 e FancI di C. elegans. - Metodologie per l' induzione di rotture del doppio filamento di DNA e co-immunorecipitazione da cellule umane - Metodologie per indurre la citoprotezione da parte dei composti in studio in seguito ad esposizione a vari tipi di radiazioni - Studio funzionale e strutturale del complesso enzimatico NurA /HerA di S. solfataricus -Identificazione di prodotti di transglicosilazione ottenuti dalla thioglycoligasi da Clostridium perfrigens - Determinazione della struttura tridimensionale di SazCA e studi d'inibizione utilizzando inibitori sensibili per questa classe di metalloproteasi. Caratterizzazione biochimica e chimico-fisica della PEPC e della RubisCO termostabili. - Purificazione, caratterizzazione del Proteasoma da specie ittiche antartiche; identificazione della specificità e del meccanismo di riconoscimento APEH-substrato ossidato; individuazione degli effetti dell'inibizione dell'APEH sui processi di plasticità sinaptica in modelli murini; analisi dei meccanismi di morte cellulare, in linee di osteosarcoma, mediati dal trattamento con il nuovo inibitore selezionato dell'APEH. - Profili d'attivazione indotti da insulina di fosfoproteine nei miotubi L6 trasformati con il fattore di trascrizione Prep1. - Caratterizzazione delle proteine presenti nelle EVs di piante. - Informazioni sulle alterazione del profilo proteico delle proteine nucleari in diversi tipi di cellule in seguito al trattamento con daunomicina e coniugati. -Pubblicazioni su riviste internazionali -Partecipazione a congressi nazionali ed internazionali (literal)
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