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					<div class="scheda"><h1>BMC bioinformatics</h1>
<dl><dt>Label</dt><dd><ul><li>BMC bioinformatics (literal)</li></ul></dd><dt>Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi</dt><dd><ul><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID56110'>The Human EST Ontology Explorer: a tissue-oriented visualization system for ontologies distribution in human EST collections (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID199359'>Characterization of an inducible promoter in different DNA copy number conditions (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID208626'>An extensible six-step methodology to automatically generate fuzzy DSSs for diagnostic applications (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID275279'>Intuitive representation of surface properties of biomolecules using BioBlender (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID248403'>On the statistical assessment of classifiers using DNA microarray data (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID8147'>Time-course whole-genome microarray analysis of estrogen effects on hormone-responsive breast cancer cells (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID26558'>A computational approach for detecting peptidases and their specific inhibitors at the genome level. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID45803'>Time-course analysis of genome-wide gene expression data from hormone-responsive human breast cancer cells (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID276897'>Bioinformatics in Italy: BITS 2012, the ninth annual meeting of the Italian Society of Bioinformatics. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID276294'>Integrating microRNA target predictions for the discovery of gene regulatory networks: a semi-supervised ensemble learning approach (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID222198'>Tandem Repeats Discovery Service (TReaDS) applied to finding novel Cis-acting factors in Repeat Expansion Diseases (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID274457'>Modeling lymphocytes homing and encounters in lymph nodes (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID44194'>SQUAT: a web tool to mine human, murine and avian SAGE data (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID282419'>A knowledge-based decision support system in bioinformatics: An application to protein complex extraction (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID72363'>Regularized least squares cancer classifiers from DNA microarray data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID215975'>VaccImm: Simulating peptide vaccination in cancer therapy (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID169081'>Overview of BITS2005, the Second Annual Meeting of the Italian Bioinformatics Society (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID171539'>Semi-automatic identification of punching areas for tissue microarray building: the tubular breast cancer pilot study (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID269857'>Identification and analysis of conserved pockets on protein surfaces (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55792'>Systematic analysis of human kinase genes: a large number of genes and alternative splicing events result in functional and structural diversity (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID221861'>Ab initio detection of fuzzy amino acid tandem repeats in protein sequences (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55797'>A hybrid genetic-neural system for predicting protein secondary structure (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID253405'>Mobilomics in Saccharomyces cerevisiae strains (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID213700'>BEAT: Bioinformatics Exon Array Tool to store, analyze and visualize Affymetrix GeneChip Human Exon Array data from disease experiments (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID4193'>Towards the integration of mouse databases - definition and implementation of solutions to two use-cases in mouse functional genomics (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55876'>Data handling strategies for high throughput pyrosequencers. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55869'>ProCMD: a database and 3D web resource for protein C mutants. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID280244'>Use of Attribute Driven Incremental Discretization and Logic Learning Machine to build a prognostic classifier for neuroblastoma patients (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID240184'>DMET-analyzer: automatic analysis of Affymetrix DMET data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID175703'>In-silico and in-vivo analyses of EST databases unveil conserved miRNAs from Carthamus tinctorius and Cynara cardunculus. (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID282417'>Alignment-free analysis of barcode sequences by means of compression-based methods (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55902'>Gene analogue finder: a GRID solution for finding functionally analogous gene products. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID26344'>Browsing isolated population data. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID31325'>A Bayesian nonparametric method for prediction in EST analysis (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID56117'>Identification of functionally related genes using data mining and data integration: a breast cancer case study (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID56113'>Towards a systems biology approach to mammalian cell cycle: modeling the entrance into S phase of quiescent fibroblasts after serum stimulation (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55921'>BGBlast: a BLAST grid implementation with database self-updating and adaptive (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55922'>Biowep: a workflow enactment portal for bioinformatics applications (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID20663'>Not proper ROC curves as new tool for the analysis of differentially expressed genes in microarray experiments (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55794'>Web services and workflow management for biological resources (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55981'>SYMBIOmatics: Synergies in Medical Informatics and Bioinformatics - exploring current scientific literature for emerging topics (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55795'>ESTree db: a tool for peach functional genomics (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID202761'>SNPranker 2.0: a gene-centric data mining tool for diseases associated SNP prioritization in GWAS (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55830'>MitoRes: a resource of nuclear-encoded mitochondrial genes and their products in Metazoa (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID168136'>ESTuber db: an online database for Tuber borchii EST sequences (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID287242'>CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human transcriptome. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID253412'>Quasi-cellular systems: stochastic simulation analysis at nanoscale range (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID56109'>In silico saturation mutagenesis and docking screening for the analysis of protein-ligand interaction: the Endothelial Protein C Receptor case study (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID188731'>Characterization of the emergent properties of a synthetic quasi-cellular system (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID7474'>A global optimization algorithm for protein surface alignment (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID14596'>mu-CS: An extension of the TM4 platform to manage Affymetrix               binary data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID284587'>A tool for mapping Single Nucleotide Polymorphisms using Graphics Processing Units (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID189289'>PIntron: a fast method for detecting the gene structure due to alternative splicing via maximal pairings of a pattern and a text (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID186272'>mu-CS: An extension of the TM4 platform to manage Affymetrix binary data (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID186265'>The EIPeptiDi tool: Enhancing peptide discovery in ICAT-based LC MS/MS experiments (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55971'>SNPLims: A Data Management System for Genome Wide Association Studies (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID208356'>Logic Learning Machine creates explicit and stable rules stratifying neuroblastoma patients (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID8053'>Protnet: a stochastic tool for dynamic simulation of protein interaction networks (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID45893'>A scale space approach for unsupervised feature selection in mass spectra classification for ovarian cancer detection (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID281286'>Guidelines for managing data and processes in bone and cartilage tissue engineering (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID192903'>IBDsite: a Galaxy-interacting, integrative database for supporting inflammatory bowel disease high throughput data analysis (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55970'>Ontology-based, Tissue MicroArray oriented, image centred tissue bank (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID7442'>Learning to classify species with barcodes (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID179400'>Statistical assessment of discriminative features for protein-coding and non coding cross-species conserved sequence elements. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID31468'>A computational framework for qualitative simulation of nonlinear dynamical models of gene-regulatory networks (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID205232'>The BioLexicon: a large-scale terminological resource for biomedical text mining (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID180056'>Computational annotation of UTR cis-regulatory modules through Frequent Pattern Mining (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55798'>Modelling the interaction of steroid receptors with endocrine disrupting chemicals (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID8195'>BATS: a Bayesian user-friendly software for Analyzing Time Series microarray experiments (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID52552'>On the statistical assessment of classifiers using DNA microarray data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID284621'>Trends in modeling Biomedical Complex Systems. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID52600'>Regularized Least Squares Cancer Classifiers from DNA microarray data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID284622'>Ontology-based, Tissue MicroArray oriented, image centered tissue bank (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID274231'>A novel biclustering algorithm for the discovery of meaningful biological correlations between microRNAs and their target genes (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID274250'>HOCCLUS2 (Software)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55878'>p53FamTaG: a database resource of human p53, p63 and p73 direct target genes combining in silico prediction and microarray data. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID195726'>Modeling Gene Regulatory Network Motifs using Statecharts (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID64093'>-based classification of biological sequences and structures via the Universal Similarity Metric: experimental assessment (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID287668'>Computational approaches for isoform detection and estimation: good and bad news (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID9646'>The bioPrompt-box: an ontology-based clustering tool for searching in biological databases (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55936'>HmtDB, a human mitochondrial genomic resource based on variability studies supporting population genetics and biomedical research. (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55967'>Reconstructing networks of pathways via significance analysis of their intersections (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55968'>Version VI of the ESTree db: an improved tool for peach transcriptome analysis (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID177177'>The 20th anniversary of EMBnet: 20 years of bioinformatics for the Life Sciences community. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55961'>Splicy: a web-based tool for the prediction of possible alternative splicing events from Affymetrix probeset data. (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID167838'>High performance workflow implementation for protein surface characterization using grid technology (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID175046'>GIDL: a rule based expert system for GenBank Intelligent Data Loading into the Molecular Biodiversity database (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li></ul></dd><dt>Alternative label</dt><dd><ul><li>BioMed Central bioinformatics (literal)</li><li>BMC bioinformatics (literal)</li><li>Bioinformatics (literal)</li></ul></dd><dt>Language</dt><dd><ul><li>eng (literal)</li></ul></dd><dt>Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#issn</dt><dd><ul><li>1471-2105 (literal)</li></ul></dd><dt>Preferred label</dt><dd><ul><li>BMC bioinformatics (literal)</li></ul></dd><dt>Publisher</dt><dd><ul><li>BioMed Central, [London] : GBR (literal)</li></ul></dd>

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<br/><h4>Incoming links:</h4><br/><dl><dt>Rivista</dt><dd><ul><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID72363'>Regularized least squares cancer classifiers from DNA microarray data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID7442'>Learning to classify species with barcodes (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID9646'>The bioPrompt-box: an ontology-based clustering tool for searching in biological databases (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID26344'>Browsing isolated population data. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID31325'>A Bayesian nonparametric method for prediction in EST analysis (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID4193'>Towards the integration of mouse databases - definition and implementation of solutions to two use-cases in mouse functional genomics (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID8053'>Protnet: a stochastic tool for dynamic simulation of protein interaction networks (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID8195'>BATS: a Bayesian user-friendly software for Analyzing Time Series microarray experiments (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID20663'>Not proper ROC curves as new tool for the analysis of differentially expressed genes in microarray experiments (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID26558'>A computational approach for detecting peptidases and their specific inhibitors at the genome level. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID31468'>A computational framework for qualitative simulation of nonlinear dynamical models of gene-regulatory networks (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID7474'>A global optimization algorithm for protein surface alignment (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID8147'>Time-course whole-genome microarray analysis of estrogen effects on hormone-responsive breast cancer cells (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID14596'>mu-CS: An extension of the TM4 platform to manage Affymetrix               binary data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID44194'>SQUAT: a web tool to mine human, murine and avian SAGE data (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55794'>Web services and workflow management for biological resources (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55795'>ESTree db: a tool for peach functional genomics (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55830'>MitoRes: a resource of nuclear-encoded mitochondrial genes and their products in Metazoa (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55869'>ProCMD: a database and 3D web resource for protein C mutants. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55876'>Data handling strategies for high throughput pyrosequencers. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55902'>Gene analogue finder: a GRID solution for finding functionally analogous gene products. 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(Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55961'>Splicy: a web-based tool for the prediction of possible alternative splicing events from Affymetrix probeset data. (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55967'>Reconstructing networks of pathways via significance analysis of their intersections (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55968'>Version VI of the ESTree db: an improved tool for peach transcriptome analysis (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55981'>SYMBIOmatics: Synergies in Medical Informatics and Bioinformatics - exploring current scientific literature for emerging topics (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID56113'>Towards a systems biology approach to mammalian cell cycle: modeling the entrance into S phase of quiescent fibroblasts after serum stimulation (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID56117'>Identification of functionally related genes using data mining and data integration: a breast cancer case study (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID64093'>-based classification of biological sequences and structures via the Universal Similarity Metric: experimental assessment (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID167838'>High performance workflow implementation for protein surface characterization using grid technology (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID175046'>GIDL: a rule based expert system for GenBank Intelligent Data Loading into the Molecular Biodiversity database (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID175703'>In-silico and in-vivo analyses of EST databases unveil conserved miRNAs from Carthamus tinctorius and Cynara cardunculus. (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID189289'>PIntron: a fast method for detecting the gene structure due to alternative splicing via maximal pairings of a pattern and a text (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID192903'>IBDsite: a Galaxy-interacting, integrative database for supporting inflammatory bowel disease high throughput data analysis (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID199359'>Characterization of an inducible promoter in different DNA copy number conditions (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID169081'>Overview of BITS2005, the Second Annual Meeting of the Italian Bioinformatics Society (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID179400'>Statistical assessment of discriminative features for protein-coding and non coding cross-species conserved sequence elements. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID186265'>The EIPeptiDi tool: Enhancing peptide discovery in ICAT-based LC MS/MS experiments (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID186272'>mu-CS: An extension of the TM4 platform to manage Affymetrix binary data (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID188731'>Characterization of the emergent properties of a synthetic quasi-cellular system (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID195726'>Modeling Gene Regulatory Network Motifs using Statecharts (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID202761'>SNPranker 2.0: a gene-centric data mining tool for diseases associated SNP prioritization in GWAS (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID168136'>ESTuber db: an online database for Tuber borchii EST sequences (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID171539'>Semi-automatic identification of punching areas for tissue microarray building: the tubular breast cancer pilot study (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID177177'>The 20th anniversary of EMBnet: 20 years of bioinformatics for the Life Sciences community. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID180056'>Computational annotation of UTR cis-regulatory modules through Frequent Pattern Mining (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID205232'>The BioLexicon: a large-scale terminological resource for biomedical text mining (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID208356'>Logic Learning Machine creates explicit and stable rules stratifying neuroblastoma patients (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID208626'>An extensible six-step methodology to automatically generate fuzzy DSSs for diagnostic applications (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID213700'>BEAT: Bioinformatics Exon Array Tool to store, analyze and visualize Affymetrix GeneChip Human Exon Array data from disease experiments (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID215975'>VaccImm: Simulating peptide vaccination in cancer therapy (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID253412'>Quasi-cellular systems: stochastic simulation analysis at nanoscale range (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID221861'>Ab initio detection of fuzzy amino acid tandem repeats in protein sequences (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID240184'>DMET-analyzer: automatic analysis of Affymetrix DMET data (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID253405'>Mobilomics in Saccharomyces cerevisiae strains (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID276897'>Bioinformatics in Italy: BITS 2012, the ninth annual meeting of the Italian Society of Bioinformatics. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID222198'>Tandem Repeats Discovery Service (TReaDS) applied to finding novel Cis-acting factors in Repeat Expansion Diseases (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID248403'>On the statistical assessment of classifiers using DNA microarray data (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID269857'>Identification and analysis of conserved pockets on protein surfaces (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID274231'>A novel biclustering algorithm for the discovery of meaningful biological correlations between microRNAs and their target genes (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID274250'>HOCCLUS2 (Software)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID275279'>Intuitive representation of surface properties of biomolecules using BioBlender (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID276294'>Integrating microRNA target predictions for the discovery of gene regulatory networks: a semi-supervised ensemble learning approach (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID274457'>Modeling lymphocytes homing and encounters in lymph nodes (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID281286'>Guidelines for managing data and processes in bone and cartilage tissue engineering (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID282419'>A knowledge-based decision support system in bioinformatics: An application to protein complex extraction (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID280244'>Use of Attribute Driven Incremental Discretization and Logic Learning Machine to build a prognostic classifier for neuroblastoma patients (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID282417'>Alignment-free analysis of barcode sequences by means of compression-based methods (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID284621'>Trends in modeling Biomedical Complex Systems. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID284622'>Ontology-based, Tissue MicroArray oriented, image centered tissue bank (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID287242'>CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human transcriptome. (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID287668'>Computational approaches for isoform detection and estimation: good and bad news (Articolo in rivista)</a> (Prodotto della ricerca)</li><li><a href='http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID284587'>A tool for mapping Single Nucleotide Polymorphisms using Graphics Processing Units (Articolo in rivista)</a> (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)</li></ul></dd>

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