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The complete nucleotide sequence of Pelargonium zonate spot virus and its relationship with the family Bromoviridae (Articolo in rivista)
- Type
- Label
- The complete nucleotide sequence of Pelargonium zonate spot virus and its relationship with the family Bromoviridae (Articolo in rivista) (literal)
- Anno
- 2003-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Alternative label
- Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori
- Finetti-Sialer M. 1, Gallitelli D. 2. (literal)
- Pagina inizio
- Pagina fine
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- I risultati di questo studio sono stati utilizzare per la proposta di istituzione di un nuovo genere, denominato Anulavirus, nella famiglia Bromoiridae. Al momento, l'unica specie virala allocata nel genere è PZSV. (literal)
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- Rivista
- Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#descrizioneSinteticaDelProdotto
- E' riportata la sequenza nucleotidica completa di Pelargonium zonate spot virus (PZSV) e su questa base ne è proposta la inclusione in un nuovo genere della famiglia Bromiviridade. E' data dimostrazione che il genoma di PZSV è costituito da tre filamenti di RNA monocatenario dio polarità positiva, tutti necessari ad iniziare il processo infettivo. E' adata dimostrazione che la proteina coinvolta nel movimento sistemico del virus nella pianta è codificata dalla prima ORF dell'RNA-3 e che la seconda ORF codifica la proteina capsidica attraverso la sintesi di un RNA subgenomico . dall'analisi non è emersa la presenza di ORF che codificano proteine del tipo 2b presenti in altri membri della famiglia Bromoviridae (literal)
- Note
- ISI Web of Science (WOS) (literal)
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- 1: Finetti-Sialer Mariella, Dottore di ricerca, Titolare di assegno di ricerca dell'Università Mediterranea di reggio Calabria
2: Gallitelli D. Professore Ordinario di Biotecnologie fitopatologiche presso la Facoltà di Scienze Biotecnologiche dell'Università degli Studi di Bari, Associato all'Istituto di Virologia Vegetale dal 01.02.2002 (literal)
- Titolo
- The complete nucleotide sequence of Pelargonium zonate spot virus and its relationship with the family Bromoviridae (literal)
- Abstract
- The complete sequence of the Pelargonium zonate spot virus (PZSV) genome was determined.
It comprises 8477 nt, distributed in three positive-strand RNA species encoding four proteins.
RNA-1 is 3383 nt long, with an ORF that encodes a polypeptide with a molecular mass of
108 419 Da (denoted protein 1a). This protein contains the conserved sequence motifs IIII of
type I methyltransferases and the seven consensus motifs of the helicases of superfamily 1.
RNA-2 is 2435 nt long and encodes a major polypeptide with a molecular mass of 78 944 Da
(denoted protein 2a), which shows identity to the RNA-dependent RNA polymerases of
positive-strand RNA viruses. RNA-3 is 2659 nt long and contains two major ORFs. The first ORF
is located in the 59 portion of the genome and sequence comparison of the putative translation
product revealed similarities with the 30K superfamily of virus movement proteins. The second
ORF is located in the 39 half and encodes the viral coat protein, which is expressed via a
subgenomic RNA, RNA-4. The transcription initiation site of RNA-4 maps to the intergenic region
of RNA-3. The organization of the PZSV genome, including the primary structure of terminal
non-coding regions, strongly suggests that this virus belongs to the family Bromoviridae. The
overall biological and genomic characteristics of PZSV indicate affinities in diverging directions
with one or other of the virus species in this family, thus enabling it to be considered as a
possible representative of a new genus within the family Bromoviridae. (literal)
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