http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID55743
Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (Articolo in rivista)
- Type
- Label
- Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (Articolo in rivista) (literal)
- Anno
- 2002-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi
- 10.1093/nar/30.1.172 (literal)
- Alternative label
Attimonelli M. , Catalano D. , Gissi C. , Grillo G. , Licciulli F. , Liuni S. , Santamaria M. , Pesole G. , Saccone C. (2002)
Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002
in Nucleic acids research
(literal)
- Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori
- Attimonelli M. , Catalano D. , Gissi C. , Grillo G. , Licciulli F. , Liuni S. , Santamaria M. , Pesole G. , Saccone C. (literal)
- Pagina inizio
- Pagina fine
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- Rivista
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- MitoNuc è una banca dati specializzata di proteine mitocondriali di origine nucleare e dei relativi geni per tutte le specie di Metazoi. La sua finalità primaria è quella di servire da supporto alla comunità scientifica internazionale interessata a studi di genomica funzionale, proteomica ed evoluzione molecolare. La banca dati MitoNuc viene generata attraverso procedure di annotazione automatica e controllo manuale dei dati utilizzando come sorgenti banche dati pubbliche tra le più accreditate. Essa viene aggiornata mediamente ogni 3 mese ed è disponibile per la consultazione al seguente indirizzo: http://www.ba.itb.cnr.it/BIGHome/ita/Sezione.htm. Attualmente, MitoNuc contiene 1344 entries; ciascuna entry riporta informazioni relative alla caratterizzazione funzionale della proteina e alle caratteristiche strutturali della relativa sequenza genica (mRNA, regioni 5 e 3 non tradotte dei trascritti genici, CDS, peptide segnale, peptide maturo). Le informazioni contenute allinterno della banca dati possono essere estratte, comprese le sequenze e le sottosequenze associate a ciascun prodotto, grazie al sistema di retrieval SRS che offre la possibilità allutente di effettuare sia query multirecord che query complesse attraverso la combinazione di criteri di ricerca differenti. (literal)
- Note
- ISI Web of Science (WOS) (literal)
- SCImago (literal)
- Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni
- Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Università di Bari, via Orabona 4, 70126 Bari, Italia
Istituto Tecnologie Biomediche,CNR -Sezione di Bari
Dipartimento di Fisiologia e Biochimica Generali, Università di Milano, via Celoria 26, Milano, Italia (literal)
- Titolo
- Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (literal)
- Abstract
- Mitochondria, besides their central role in energy metabolism, have
recently been found to be involved in a number of basic processes of cell
life and to contribute to the pathogenesis of many degenerative diseases.
All functions of mitochondria depend on the interaction of nuclear and
organelle genomes. Mitochondrial genomes have been extensively sequenced
and analysed and data have been collected in several specialised
databases. In order to collect information on nuclear coded mitochondrial
proteins we developed MitoNuc, a database containing detailed information
on sequenced nuclear genes coding for mitochondrial proteins in Metazoa.
The MitoNuc database can be retrieved through SRS and is available via the
web site http://bighost.area.ba.cnr.it/mitochondriome where other
mitochondrial databases developed by our group, the complete list of the
sequenced mitochondrial genomes, links to other mitochondrial sites and
related information, are available. The MitoAln database, related to
MitoNuc in the previous release, reporting the multiple alignments of the
relevant homologous protein coding regions, is no longer supported in the
present release. In order to keep the links among entries in MitoNuc from
homologous proteins, a new field in the database has been defined: the
cluster identifier, an alpha numeric code used to identify each cluster of
homologous proteins. A comment field derived from the corresponding SWISS-
PROT entry has been introduced; this reports clinical data related to
dysfunction of the protein. The logic scheme of MitoNuc database has been
implemented in the ORACLE DBMS. This will allow the end-users to retrieve
data through a friendly interface that will be soon implemented (literal)
- Prodotto di
- Autore CNR
- Insieme di parole chiave
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