Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (Articolo in rivista)

Type
Label
  • Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (Articolo in rivista) (literal)
Anno
  • 2002-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi
  • 10.1093/nar/30.1.172 (literal)
Alternative label
  • Attimonelli M. , Catalano D. , Gissi C. , Grillo G. , Licciulli F. , Liuni S. , Santamaria M. , Pesole G. , Saccone C. (2002)
    Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002
    in Nucleic acids research
    (literal)
Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori
  • Attimonelli M. , Catalano D. , Gissi C. , Grillo G. , Licciulli F. , Liuni S. , Santamaria M. , Pesole G. , Saccone C. (literal)
Pagina inizio
  • 172 (literal)
Pagina fine
  • 173 (literal)
Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume
  • 30 (literal)
Rivista
Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroFascicolo
  • 1 (literal)
Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#descrizioneSinteticaDelProdotto
  • MitoNuc è una banca dati specializzata di proteine mitocondriali di origine nucleare e dei relativi geni per tutte le specie di Metazoi. La sua finalità primaria è quella di servire da supporto alla comunità scientifica internazionale interessata a studi di genomica funzionale, proteomica ed evoluzione molecolare. La banca dati MitoNuc viene generata attraverso procedure di annotazione automatica e controllo manuale dei dati utilizzando come sorgenti banche dati pubbliche tra le più accreditate. Essa viene aggiornata mediamente ogni 3 mese ed è disponibile per la consultazione al seguente indirizzo: http://www.ba.itb.cnr.it/BIGHome/ita/Sezione.htm. Attualmente, MitoNuc contiene 1344 entries; ciascuna entry riporta informazioni relative alla caratterizzazione funzionale della proteina e alle caratteristiche strutturali della relativa sequenza genica (mRNA, regioni 5’ e 3’ non tradotte dei trascritti genici, CDS, peptide segnale, peptide maturo). Le informazioni contenute all’interno della banca dati possono essere estratte, comprese le sequenze e le sottosequenze associate a ciascun prodotto, grazie al sistema di retrieval SRS che offre la possibilità all’utente di effettuare sia query multirecord che query complesse attraverso la combinazione di criteri di ricerca differenti. (literal)
Note
  • ISI Web of Science (WOS) (literal)
  • SCImago (literal)
Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni
  • Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Università di Bari, via Orabona 4, 70126 Bari, Italia Istituto Tecnologie Biomediche,CNR -Sezione di Bari Dipartimento di Fisiologia e Biochimica Generali, Università di Milano, via Celoria 26, Milano, Italia (literal)
Titolo
  • Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (literal)
Abstract
  • Mitochondria, besides their central role in energy metabolism, have recently been found to be involved in a number of basic processes of cell life and to contribute to the pathogenesis of many degenerative diseases. All functions of mitochondria depend on the interaction of nuclear and organelle genomes. Mitochondrial genomes have been extensively sequenced and analysed and data have been collected in several specialised databases. In order to collect information on nuclear coded mitochondrial proteins we developed MitoNuc, a database containing detailed information on sequenced nuclear genes coding for mitochondrial proteins in Metazoa. The MitoNuc database can be retrieved through SRS and is available via the web site http://bighost.area.ba.cnr.it/mitochondriome where other mitochondrial databases developed by our group, the complete list of the sequenced mitochondrial genomes, links to other mitochondrial sites and related information, are available. The MitoAln database, related to MitoNuc in the previous release, reporting the multiple alignments of the relevant homologous protein coding regions, is no longer supported in the present release. In order to keep the links among entries in MitoNuc from homologous proteins, a new field in the database has been defined: the cluster identifier, an alpha numeric code used to identify each cluster of homologous proteins. A comment field derived from the corresponding SWISS- PROT entry has been introduced; this reports clinical data related to dysfunction of the protein. The logic scheme of MitoNuc database has been implemented in the ORACLE DBMS. This will allow the end-users to retrieve data through a friendly interface that will be soon implemented (literal)
Prodotto di
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Insieme di parole chiave di
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