Modeling the Backbone Dynamics of reduced and Oxidized Solvated Rat Microsomal Cytochrome b5 (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• Modeling the Backbone Dynamics of reduced and Oxidized Solvated Rat Microsomal Cytochrome b5 (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2004-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1529/biophysj.103.036557 (literal)

Alternative label

• Giacchetti A.; La Penna G.; Perico A.; Banci L. (2004)
  Modeling the Backbone Dynamics of reduced and Oxidized Solvated Rat Microsomal Cytochrome b5
  in Biophysical journal (Print)
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Giacchetti A.; La Penna G.; Perico A.; Banci L. (literal)

Pagina inizio

• 498 (literal)

Pagina fine

• 515 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#url

• http://dx.doi.org/10.1529/biophysj.103.036557 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 87 (literal)

Rivista

• Biophysical journal (Rivista)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• ISMAC-GE: G. La Penna, A. Perico U. Firenze, CERM:A. Giacchetti, L. Banci (literal)

Titolo

• Modeling the Backbone Dynamics of reduced and Oxidized Solvated Rat Microsomal Cytochrome b5 (literal)

Abstract

• In this article, a description of the statistics and dynamics of cytochrome b5 in both reduced and oxidized forms is given. Results of molecular dynamics computer simulations in the explicit solvent have been combined with mode-coupling diffusion models including and neglecting the molecule-solvent correlations. R1 and R1rho nuclear magnetic relaxation parameters of 15N in the protein backbone have been calculated and compared with experiments. Slight changes in charge density in the heme upon oxidation produces a cascade of changes in charge distributions from heme propionates up to charged residues ~1.5 nm from Fe. These changes in charge distributions modify the molecular surface and the water shell surrounding the protein. The statistical changes upon oxidation can be included in diffusive models that physically explain the upper and lower limits of R1rho relaxation parameters at high off-resonance fields. (literal)

Prodotto di

• Interazione proteine-acidi nucleici e farmacogenomica (SV.P14.001.001) (Modulo)
• Istituto per lo studio delle macromolecole (ISMAC) (Istituto)

Autore CNR

• ANGELO PERICO (Unità di personale interno)
• GIOVANNI LA PENNA (Unità di personale interno)

Insieme di parole chiave

• Parole chiave di "Modeling the Backbone Dynamics of reduced and Oxidized Solvated Rat Microsomal Cytochrome b5" (Insieme di parole chiave)

Incoming links:

Prodotto

• Istituto per lo studio delle macromolecole (ISMAC) (Istituto)
• Interazione proteine-acidi nucleici e farmacogenomica (SV.P14.001.001) (Modulo)

Autore CNR di

• ANGELO PERICO (Unità di personale interno)
• GIOVANNI LA PENNA (Unità di personale interno)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Biophysical journal (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Parole chiave di "Modeling the Backbone Dynamics of reduced and Oxidized Solvated Rat Microsomal Cytochrome b5" (Insieme di parole chiave)