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Physiological, biochemical and molecular analyses of an Italian collection of Agrobacterium tumefaciens strains. (Articolo in rivista)

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Physiological, biochemical and molecular analyses of an Italian collection of Agrobacterium tumefaciens strains. (Articolo in rivista) (literal)

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Peluso R., Raio A., Morra F., Zoina A. (2003)
Physiological, biochemical and molecular analyses of an Italian collection of Agrobacterium tumefaciens strains.
in European journal of plant pathology
(literal)

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Lo studio è stato finanziato dal progetto EU Contract: ERBIC18CT970198, Integrated control of crown gall in Mediterranean countries. Impact Factor: 1.1 (literal)

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Rivista

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Larticolo riguarda lo studio delle caratteristiche di un gruppo di batteri afferenti alla specie Agrobacterium tumefaciens rappresentativi di unampia collezione. Gli isolati sono stati ottenuti da tumori presenti su numerose specie di piante da frutto e ornamentali provenienti da diverse regioni italiane. Sono state considerate le caratteristiche biochimico-fisiologiche e molecolari allo scopo di evidenziare eventuali correlazioni tra genotipo-pianta ospite-area di origine. Lo studio molecolare è stato effettuato mediante analisi PCR-RFLP del gene rrs e dello spazio intergenico tra le regioni ribosomiali 16S e 23S. Questo tipo di analisi consente nellambito delle specie afferenti al genere Agrobacterium di identificare i singoli genotipi. Lanalisi filogenetica dei profili di restrizione ha evidenziato che gran parte dei ceppi costituivano un cluster omogeneo che includeva i ceppi biovar 2; tra questi solo i ceppi provenienti dalla Sardegna differivano nettamente da tutti gli altri isolati ottenuti dalle piante prelevate nelle altre regioni italiane. Questi risultati indicherebbero che gli agrobatteri in questa regione hanno probabilmente seguito unevoluzione diversa. I ceppi biovar 1 si ripartivano in più sottogruppi, evidenziando una più ampia variabilità genetica di questa biovar. (literal)

Note

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-Peluso R., Morra F., Zoina A., Dipartimento di Arboricoltura, Botanica e Patologia Vegetale, Università di Napoli Federico II, Via Università, 100, 80055 Portici (NA), Italy -Raio A., Istituto per la Protezione delle Piante-CNR, Via Università, 133, 80055 Portici (NA), Italy (literal)

Titolo

Physiological, biochemical and molecular analyses of an Italian collection of Agrobacterium tumefaciens strains. (literal)

Abstract

Physiological, biochemical and molecular characteristics of Agrobacterium tumefaciens strains isolated in Italy from different host plants were analysed. Diseased plants were collected from several nurseries located in nine different regions. Out of 1293 strains isolated from 12 fruit tree and six ornamental plant species, a group of 120 strains was chosen as representative of the whole collection. The majority of the strains were biovar 2, agrocin 84 sensitive, and were isolated from stone fruit trees. Most of the strains identified as biovar 1 were isolated from ornamental plants and were insensitive to A. radiobacter antagonistic strain K84. Some strain that were isolated from Euonymous spp., Prunus GF677 and Pyrus communis tumors could not be allocated to any of the three Agrobacterium biovars. PCR-RFLP of the rrs gene plus the intergenic spacer was used for strain fingerprinting and characterization. Results showed a wide genetic variability within the biovar 1 strains and homogeneity within the biovar 2 group. Biovar 2 strains from Sardinia were highly variable and differed from the biovar 2 strains isolated from the other regions of Italy. (literal)

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