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Le opportunità del next generation sequencing nella ricerca e nella diagnosi fitovirologica (Articolo in rivista)

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Le opportunità del next generation sequencing nella ricerca e nella diagnosi fitovirologica (Articolo in rivista) (literal)

Anno

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Saldarelli P., Giampetruzzi A., Loconsole G., Chiumenti M., Saponari M., Minafra A. (2014)
Le opportunità del next generation sequencing nella ricerca e nella diagnosi fitovirologica
in Protezione delle colture
(literal)

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Saldarelli P., Giampetruzzi A., Loconsole G., Chiumenti M., Saponari M., Minafra A. (literal)

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Chiumenti M. Dipartimento di Scienze del Suolo della Pianta e degli Alimenti, Università degli Studi di Bari and Rete regionale di laboratori per la selezione, caratterizzazione e conservazione di germoplasma e per la prevenzione della diffusione di organismi nocivi di rilevanza economica e da quarantena (SELGE), via Amendola 165/A, 70126, Bari, Italy; (literal)

Titolo

Le opportunità del next generation sequencing nella ricerca e nella diagnosi fitovirologica (literal)

Abstract

L'introduzione di nuovi metodi di sequenziamento stà rivoluzionando le potenzialità diagnostiche e di ricerca in campo vegetale. Queste tecnologie di sequenziamento di nuova generazione (NGS), non necessitano di alcuna conoscenza preliminare sul contenuto in acidi nucleici, virali e dell'ospite, dei tessuti sottoposti ad analisi. Il loro utilizzo permette di condurre un'analisi metagenomica sul campione in esame, che può essere costituito da una singola pianta o provenire da più piante. Da un punto di vista fitopatologico, queste nuove tecnologie rivelano la complessità del \"viroma\" (l'insieme di virus e viroidi) del campione e delle sue interazioni con il genoma dell'ospite, laddove questo è noto. Dal punto di vista diagnostico il metodo velocizza la scoperta e l'identificazione di nuovi o già noti virus, la sequenza del loro genoma e lo sviluppo di nuovi e specifici metodi di diagnosi. (literal)

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