Molecular Mechanism of Allosteric Communication in Hsp70 Revealed by Molecular Dynamics Simulations (Contributo in atti di convegno)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Contributo in atti di convegno (Classe)

Label

• Molecular Mechanism of Allosteric Communication in Hsp70 Revealed by Molecular Dynamics Simulations (Contributo in atti di convegno) (literal)

Anno

• 2013-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1371/journal.pcbi.1002844 (literal)

Alternative label

• Chiappori, Federica; Merelli, Ivan; Colombo, Giorgio; Milanesi, Luciano; Morra, Giulia (2013)
  Molecular Mechanism of Allosteric Communication in Hsp70 Revealed by Molecular Dynamics Simulations
  in Biophysical Society 57th annual meeting, Philadelphia, February 2-6, 2013
  (literal)

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• Chiappori, Federica; Merelli, Ivan; Colombo, Giorgio; Milanesi, Luciano; Morra, Giulia (literal)

Pagina inizio

• 571A (literal)

Pagina fine

• 571A (literal)

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• 8 (literal)

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• 8 (literal)

Rivista

• Biophysical journal (Rivista)

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• 15 (literal)

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• 12 (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

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• ITB CNR; ICRM CNR (literal)

Titolo

• Molecular Mechanism of Allosteric Communication in Hsp70 Revealed by Molecular Dynamics Simulations (literal)

Abstract

• Investigating ligand-regulated allosteric coupling between protein domains is fundamental to understand cell-life regulation. The Hsp70 family of chaperones represents an example of proteins in which ATP binding and hydrolysis at the Nucleotide Binding Domain (NBD) modulate substrate recognition at the Substrate Binding Domain (SBD). Herein, a comparative analysis of an allosteric (Hsp70-DnaK) and a non-allosteric structural homolog (Hsp110-Sse1) of the Hsp70 family is carried out through molecular dynamics simulations, starting from different conformations and ligand-states. Analysis of ligand-dependent modulation of internal fluctuations and local deformation patterns highlights the structural and dynamical changes occurring at residue level upon ATP-ADP exchange, which are connected to the conformational transition between closed and open structures. By identifying the dynamically responsive protein regions and specific cross-domain hydrogen-bonding patterns that differentiate Hsp70 from Hsp110 as a function of the nucleotide, we propose a molecular mechanism for the allosteric signal propagation of the ATP-encoded conformational signal. (literal)

Prodotto di

• Applicazioni di approcci multidisciplinari \"Omics\" per l'individuazione di Biomarcatori e per indagini a livello molecolare (INT.P02.015.002) (Modulo)
• Istituto di chimica del riconoscimento molecolare (ICRM) (Istituto)
• Bioinformatica in Biomedicina (ME.P06.027.001) (Modulo)

Autore CNR

• GIORGIO COLOMBO (Unità di personale interno)
• Federica Chiappori (Unità di personale esterno)
• GIULIA MORRA (Persona)
• LUCIANO MILANESI (Persona)
• IVAN MERELLI (Unità di personale interno)

Incoming links:

Prodotto

• Istituto di chimica del riconoscimento molecolare (ICRM) (Istituto)
• Applicazioni di approcci multidisciplinari \"Omics\" per l'individuazione di Biomarcatori e per indagini a livello molecolare (INT.P02.015.002) (Modulo)
• Bioinformatica in Biomedicina (ME.P06.027.001) (Modulo)
• http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/modulo/ID8867

Autore CNR di

• LUCIANO MILANESI (Persona)
• GIORGIO COLOMBO (Unità di personale interno)
• IVAN MERELLI (Unità di personale interno)
• Federica Chiappori (Unità di personale esterno)
• GIULIA MORRA (Persona)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Biophysical journal (Rivista)