Structural and functional characterization of noncoding repetitive RNAs transcribed in stressed human cells. (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• Structural and functional characterization of noncoding repetitive RNAs transcribed in stressed human cells. (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2005-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1091/mbc.E04-12-1078 (literal)

Alternative label

• Valgardsdottir R., Chiodi I., Giordano M., Cobianchi F., Riva S., Biamonti G. (2005)
  Structural and functional characterization of noncoding repetitive RNAs transcribed in stressed human cells.
  in Molecular biology of the cell
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Valgardsdottir R., Chiodi I., Giordano M., Cobianchi F., Riva S., Biamonti G. (literal)

Pagina inizio

• 2597 (literal)

Pagina fine

• 2604 (literal)

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• Il lavoro suggerisce che i trascritti di satellite III possano avere un ruolo nella regolazione dello splicing alternativo agendo come decoys naturali che sequestrano una serie specifica di fattori di splicing. (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 16 (literal)

Rivista

• Molecular biology of the cell (Rivista)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#note

• Impact factor = 7.517 (literal)

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• 6 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#descrizioneSinteticaDelProdotto

• In questo lavoro abbiamo analizzato la struttura dei nuclear stress bodies, un nuovo comparto nucleare specifico delle cellule umane identificato nel nostro laboratorio. Questa struttura è rivelabile per un breve intervallo di tempo in cellule sottoposte a stress termico. Gli stress bodies sono siti di accumulo di fattori di splicing. Questi comparti si formano in corrispondenza di regioni eterocromatiche pericentromeriche del menoma umano costituite di DNA satellite III. Lo stress termico induce l’attivazione trascrizionale di queste regioni con la produzione di notevoli quantità di trascritti di Satellite III. In questo lavoro abbiamo clonato i trascritti dimostrando che sono costituiti solo dal filamento ricco in G del Satellite III. I trascritti sono una componente stabile delle strutture. I trascritti vengono legati specificamente dalle RNA binding proteins presenti nei nuclear stress bodies e sono responsabili del loro reclutamento (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

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• IGM-CNR, Pavia, Italy (literal)

Titolo

• Structural and functional characterization of noncoding repetitive RNAs transcribed in stressed human cells. (literal)

Abstract

• Thermal and chemical stresses induce the formation in human cells of novel and transient nuclear structures called nuclear stress bodies (nSBs). These contain heat shock factor 1 (HSF-1) and a specific subset of pre-mRNA processing factors. Nuclear stress bodies are assembled on specific pericentromeric heterochromatic domains containing satellite III (SatIII) DNA. In response to stress, these domains change their epigenetic status from heterochromatin to euchromatin and are transcribed in poly-adenylated RNAs that remain associated with nSBs. In this article, we describe the cloning, sequencing, and functional characterization of these transcripts. They are composed of SatIII repeats and originate from the transcription of multiple sites within the SatIII arrays. Interestingly, the level of SatIII RNAs can be down-regulated both by antisense oligonucleotides and small interfering RNAs (siRNA). Knockdown of SatIII RNA by siRNAs requires the activity of Argonaute 2, a component of the RNA-induced silencing complex. Down-regulation of satellite III RNAs significantly affects the recruitment of RNA processing factors to nSBs without altering the association of HSF-1 with these structures nor the presence of acetylated histones within nSBs. Thus, satellite III RNAs have a major role in the formation of nSBs. (literal)

Prodotto di

• Studio della regolazione post-trascrizionale dell'espressione genica in risposta a stress. Fattori che controllano lo splicing dei mRNA in cellule normali e nei tumori. (SV.P13.001.001) (Modulo)
• Institute of molecular genetics (IGM) (Istituto)
• Cromosomi artificiali per terapia genica. Studi sulla replicazione del DNA in cellule umane ; controllo del ciclo cellulare e della proliferazione. (ME.P05.006.001) (Modulo)

Autore CNR

• FABIO COBIANCHI (Persona)
• GIUSEPPE BIAMONTI (Unità di personale interno)
• SILVANO RIVA (Unità di personale interno)

Insieme di parole chiave

• Parole chiave di "Structural and functional characterization of noncoding repetitive RNAs transcribed in stressed human cells." (Insieme di parole chiave)

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Prodotto

• Institute of molecular genetics (IGM) (Istituto)
• Cromosomi artificiali per terapia genica. Studi sulla replicazione del DNA in cellule umane ; controllo del ciclo cellulare e della proliferazione. (ME.P05.006.001) (Modulo)
• Studio della regolazione post-trascrizionale dell'espressione genica in risposta a stress. Fattori che controllano lo splicing dei mRNA in cellule normali e nei tumori. (SV.P13.001.001) (Modulo)

Autore CNR di

• FABIO COBIANCHI (Persona)
• GIUSEPPE BIAMONTI (Unità di personale interno)
• SILVANO RIVA (Unità di personale interno)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Molecular biology of the cell (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Parole chiave di "Structural and functional characterization of noncoding repetitive RNAs transcribed in stressed human cells." (Insieme di parole chiave)