BLOG 2.0: a software system for character-based species classification with DNA Barcode sequences. What it does, how to use it (Articolo in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Articolo in rivista (Classe)

Label

• BLOG 2.0: a software system for character-based species classification with DNA Barcode sequences. What it does, how to use it (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2013-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1111/1755-0998.12073 (literal)

Alternative label

• Emanuel Weitschek, Robin Van Velzen, Giovanni Felici, Paola Bertolazzi (2013)
  BLOG 2.0: a software system for character-based species classification with DNA Barcode sequences. What it does, how to use it
  in Molecular ecology resources (Print)
  (literal)

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• Emanuel Weitschek, Robin Van Velzen, Giovanni Felici, Paola Bertolazzi (literal)

Pagina inizio

• 1043 (literal)

Pagina fine

• 1046 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 13 (literal)

Rivista

• Molecular ecology resources (Rivista)

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• 4 (literal)

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• 6 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• Istituto di Analisi dei Sistemi e Informatica \"Antonio Ruberti\", Consiglio Nazionale delle Ricerche, Biosystematics Group, Wageningen University, Wageningen, Istituto di Analisi dei Sistemi e Informatica \"Antonio Ruberti\", Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Analisi dei Sistemi e Informatica \"Antonio Ruberti\", Consiglio Nazionale delle Ricerche. (literal)

Titolo

• BLOG 2.0: a software system for character-based species classification with DNA Barcode sequences. What it does, how to use it (literal)

Abstract

• In this paper we investigate logic classification and related feature selection algorithms for large biomedical data sets. When the data is in binary/logic form, the feature selection problem can be formulated as a Set Covering problem of very large dimensions, whose solution is computationally challenging. We propose an alternative approximated formulation for feature selection that results in an extension of Set Covering of compact size, and use the logic classifier Lsquare to test its performances on two well-known data sets. An ad hoc metaheuristic of the GRASP type is used to solve efficiently the feature selection problem. A simple and effective method to convert rational data into logic data by interval mapping is also described. The computational results obtained are promising and the use of logic models, that can be easily understood and integrated with other domain knowledge, is one of the major strengths of this approach. (literal)

Prodotto di

• Ottimizzazione e modellistica matematica in biologia (INT.P02.003.001) (Modulo)
• Istituto di analisi dei sistemi ed informatica \"Antonio Ruberti\" (IASI) (Istituto)

Autore CNR

• GIOVANNI FELICI (Unità di personale interno)
• PAOLA BERTOLAZZI (Unità di personale interno)

Incoming links:

Autore CNR di

• PAOLA BERTOLAZZI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI FELICI (Unità di personale interno)

Prodotto

• Istituto di analisi dei sistemi ed informatica \"Antonio Ruberti\" (IASI) (Istituto)
• Ottimizzazione e modellistica matematica in biologia (INT.P02.003.001) (Modulo)

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• Molecular ecology resources (Rivista)