Investigating biological systems using first principles Car-Parrinello molecular dynamics simulations (Articolo in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Articolo in rivista (Classe)

Label

• Investigating biological systems using first principles Car-Parrinello molecular dynamics simulations (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2007-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Alternative label

• Dal Peraro, M; Ruggerone, P; Raugei, S; Gervasi, FL; Carloni, P (2007)
  Investigating biological systems using first principles Car-Parrinello molecular dynamics simulations
  in Current opinion in structural biology
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Dal Peraro, M; Ruggerone, P; Raugei, S; Gervasi, FL; Carloni, P (literal)

Pagina inizio

• 149 (literal)

Pagina fine

• 156 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 17 (literal)

Rivista

• Current opinion in structural biology (Rivista)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• Scuola Int Super Studi Avanzati, I-34100 Trieste, Italy; INFM Democritos, I-34100 Trieste, Italy; Univ Penn, Ctr Mol Modeling, Dept Chem, Philadelphia, PA 19104 USA; Univ Cagliari, CNR, INFM, Slacs & Phys Dept, I-09042 Monserrata, CA, Italy; Swiss Fed Inst Technol, Dept Chem & Appl Biosci, CH-6900 Lugano, Switzerland (literal)

Titolo

• Investigating biological systems using first principles Car-Parrinello molecular dynamics simulations (literal)

Abstract

• Density functional theory (DFT)-based Car-Parrinello molecular dynamics (CPMD) simulations describe the time evolution of molecular systems without resorting to a predefined potential energy surface. CPMD and hybrid molecular mechanics/CPMD schemes have recently enabled the calculation of redox properties of electron transfer proteins in their complex biological environment. They provided structural and spectroscopic information on novel platinum-based anticancer drugs that target DNA, also setting the basis for the construction of force fields for the metal lesion. Molecular mechanics/CPMD also lead to mechanistic hypotheses for a variety of metalloenzymes. Recent advances that increase the accuracy of DFT and the efficiency of investigating rare events are further expanding the domain of CPMD applications to biomolecules. (literal)

Prodotto di

• Teoria e modeling computazionale di materiali e processi per le nanoscienze (MD.P06.014.001) (Modulo)
• Modelizzazione molecolare di sistemi biologici (MD.P06.026.001) (Modulo)

Autore CNR

• PAOLO CARLONI (Unità di personale esterno)
• PAOLO RUGGERONE (Unità di personale esterno)
• SIMONE RAUGEI (Unità di personale esterno)

Insieme di parole chiave

• Parole chiave di "Investigating biological systems using first principles Car-Parrinello molecular dynamics simulations" (Insieme di parole chiave)

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Autore CNR di

• PAOLO RUGGERONE (Unità di personale esterno)
• PAOLO CARLONI (Unità di personale esterno)
• SIMONE RAUGEI (Unità di personale esterno)

Prodotto

• Teoria e modeling computazionale di materiali e processi per le nanoscienze (MD.P06.014.001) (Modulo)
• Modelizzazione molecolare di sistemi biologici (MD.P06.026.001) (Modulo)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Current opinion in structural biology (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Parole chiave di "Investigating biological systems using first principles Car-Parrinello molecular dynamics simulations" (Insieme di parole chiave)