CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human trascriptome. (Abstract/Poster in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Abstract/Poster in rivista (Classe)

Label

• CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human trascriptome. (Abstract/Poster in rivista) (literal)

Anno

• 2012-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Alternative label

• Cremaschi P, Rovida S, Sacchi L, Lisa A, Montecucco A, Biamonti G, Bione S, Sacchi G. (2012)
  CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human trascriptome.
  
  (literal)

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• Cremaschi P, Rovida S, Sacchi L, Lisa A, Montecucco A, Biamonti G, Bione S, Sacchi G. (literal)

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• 103 (literal)

Pagina fine

• 105 (literal)

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• Congresso internazionale NETTAB 2012, Como, 14-16 novembre 2012 (literal)

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• http://journal.embnet.org/index.php/embnetjournal/article/view/566 (literal)

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• 18 (literal)

Rivista

• EMBnet journal (Rivista)

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• 3 (literal)

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• B (literal)

Note

• Abstract (literal)
• Google Scholar (literal)

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• Institute of Molecular Genetics, CNR, Pavia, Italy; Institute of Applied Mathematics and Information Technology \"Enrico Magenes\", CNR, Pavia, Italy; Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell'Informazione, University of Pavia, Italy (literal)

Titolo

• CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human trascriptome. (literal)

Abstract

• The comprehension of the molecular mechanisms involved in the physiology of human cells and in the pathogenesis of complex disorders, requires the development of new bioinformatic and biostatistic approaches able to integrate and interpret the huge amount of data derived from different kind of \"omics\" technologies. Nowadays, the interpretation of the transcriptional state of the cell and its alterations in particular experimental or pathological conditions is of particular interest. To this aim several technologies have been developed to identify and quantify the entire set of cellular transcripts, thus resulting in the availability of expression profiles of many different cell types in many different conditions. With the aim of contributing to the elucidation of transcriptional dynamics in the cell, we developed CorrelaGenes, a new bioinformatic tool that exploits the expression data available in the Gene Expression Omnibus (GEO) database: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ (Last accessed on Sep 26, 2012). The main goal of this tool is to help identifying sets of genes whose expression appeared simultaneously altered in different experiments, thus suggesting co-regulation or coordinated action in the same biological process. (literal)

Editore

• EMBnet Stichting (Editore)

Prodotto di

• Istituto di matematica applicata e tecnologie informatiche \"Enrico Magenes\" (IMATI) (Istituto)
• Metodi e algoritmi per la risoluzione di problemi complessi in ambienti di calcolo ad alte prestazioni (ICT.P11.011.002) (Modulo)
• Biologia Computazionale (ME.P07.005.001) (Modulo)
• Institute of molecular genetics (IGM) (Istituto)

Autore CNR

• ALESSANDRA MONTECUCCO (Unità di personale interno)
• SERGIO CESARE ROVIDA (Unità di personale interno)
• ANTONELLA LISA (Persona)
• SILVIA BIONE (Unità di personale interno)
• Paolo CREMASCHI (Unità di personale esterno)
• GIUSEPPE BIAMONTI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI SACCHI (Persona)

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Prodotto

• Institute of molecular genetics (IGM) (Istituto)
• Istituto di matematica applicata e tecnologie informatiche \"Enrico Magenes\" (IMATI) (Istituto)
• Biologia Computazionale (ME.P07.005.001) (Modulo)
• Metodi e algoritmi per la risoluzione di problemi complessi in ambienti di calcolo ad alte prestazioni (ICT.P11.011.002) (Modulo)

Autore CNR di

• SILVIA BIONE (Unità di personale interno)
• ANTONELLA LISA (Persona)
• ALESSANDRA MONTECUCCO (Unità di personale interno)
• GIUSEPPE BIAMONTI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI SACCHI (Persona)
• SERGIO CESARE ROVIDA (Unità di personale interno)
• Paolo CREMASCHI (Unità di personale esterno)

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