EDM-DEDM and protein crystal structure solution (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• EDM-DEDM and protein crystal structure solution (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2009-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1107/S0907444909008609 (literal)

Alternative label

• Caliandro R., Carrozzini B., Cascarano G.L., Giacovazzo C., Mazzone A.M., Siliqi D. (2009)
  EDM-DEDM and protein crystal structure solution
  in Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography.
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Caliandro R., Carrozzini B., Cascarano G.L., Giacovazzo C., Mazzone A.M., Siliqi D. (literal)

Pagina inizio

• 477 (literal)

Pagina fine

• 484 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 65 (literal)

Rivista

• Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography. (Rivista)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• CNR-IC (literal)

Titolo

• EDM-DEDM and protein crystal structure solution (literal)

Abstract

• Electron-density modification (EDM) procedures are the classical tool for driving model phases closer to those of the target structure. They are often combined with automated model-building programs to provide a correct protein model. The task is not always performed, mostly because of the large initial phase error. A recently proposed procedure combined EDM with DEDM (difference electron-density modification); the method was applied to the refinement of phases obtained by molecular replacement, ab initio or SAD phasing [Caliandro, Carrozzini, Cascarano, Giacovazzo, Mazzone & Siliqi (2009), Acta Cryst. D65, 249-256] and was more effective in improving phases than EDM alone. In this paper, a novel fully automated protocol for protein structure refinement based on the iterative application of automated model-building programs combined with the additional power derived from the EDM-DEDM algorithm is presented. The cyclic procedure was successfully tested on challenging cases for which all other approaches had failed. (literal)

Prodotto di

• Sviluppo e applicazione di metodologie computazionali per la determinazione strutturale di biomolecole mediante diffrazione di neutroni (PM.P07.011.002) (Modulo)
• Institute of Crystallography (IC) (Istituto)

Autore CNR

• BENEDETTA CARROZZINI (Persona)
• CARMELO GIACOVAZZO (Unità di personale esterno)
• ROCCO CALIANDRO (Persona)
• DRITAN SILIQI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI LUCA CASCARANO (Unità di personale interno)
• ANNAMARIA MAZZONE (Unità di personale interno)

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Autore CNR di

• BENEDETTA CARROZZINI (Persona)
• ROCCO CALIANDRO (Persona)
• DRITAN SILIQI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI LUCA CASCARANO (Unità di personale interno)
• ANNAMARIA MAZZONE (Unità di personale interno)
• CARMELO GIACOVAZZO (Unità di personale esterno)

Prodotto

• Institute of Crystallography (IC) (Istituto)
• Sviluppo e applicazione di metodologie computazionali per la determinazione strutturale di biomolecole mediante diffrazione di neutroni (PM.P07.011.002) (Modulo)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography. (Rivista)