New computational tools for H/D determination in macromolecular structures from neutron data (Articolo in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Articolo in rivista (Classe)

Label

• New computational tools for H/D determination in macromolecular structures from neutron data (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2010-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1107/S0907444910026107 (literal)

Alternative label

• D. Siliqi, R. Caliandro, B. Carrozzini, G.L. Cascarano, A. Mazzone (2010)
  New computational tools for H/D determination in macromolecular structures from neutron data
  in Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography.
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• D. Siliqi, R. Caliandro, B. Carrozzini, G.L. Cascarano, A. Mazzone (literal)

Pagina inizio

• 1164 (literal)

Pagina fine

• 1171 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 66 (literal)

Rivista

• Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography. (Rivista)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• CNR-IC, Sede di Bari (literal)

Titolo

• New computational tools for H/D determination in macromolecular structures from neutron data (literal)

Abstract

• Two new computational methods dedicated to neutron crystallography, called n-FreeLunch and DNDM-NDM, have been developed and successfully tested. The aim in developing these methods is to determine hydrogen and deuterium positions in macromolecular structures by using information from neutron density maps. Of particular interest is resolving cases in which the geometrically predicted hydrogen or deuterium positions are ambiguous. The methods are an evolution of approaches that are already applied in X-ray crystallography: extrapolation beyond the observed resolution (known as the FreeLunch procedure) and a difference electron-density modification (DEDM) technique combined with the electron-density modification (EDM) tool (known as DEDM-EDM). It is shown that the two methods are complementary to each other and are effective in finding the positions of H and D atoms in neutron density maps. (literal)

Prodotto di

• Institute of Crystallography (IC) (Istituto)
• Sviluppo e applicazione di metodologie computazionali per la determinazione strutturale di biomolecole mediante diffrazione di neutroni (PM.P07.011.002) (Modulo)

Autore CNR

• ROCCO CALIANDRO (Persona)
• BENEDETTA CARROZZINI (Persona)
• DRITAN SILIQI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI LUCA CASCARANO (Unità di personale interno)
• ANNAMARIA MAZZONE (Unità di personale interno)

Incoming links:

Autore CNR di

• BENEDETTA CARROZZINI (Persona)
• ROCCO CALIANDRO (Persona)
• DRITAN SILIQI (Unità di personale interno)
• GIOVANNI LUCA CASCARANO (Unità di personale interno)
• ANNAMARIA MAZZONE (Unità di personale interno)

Prodotto

• Institute of Crystallography (IC) (Istituto)
• Sviluppo e applicazione di metodologie computazionali per la determinazione strutturale di biomolecole mediante diffrazione di neutroni (PM.P07.011.002) (Modulo)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography. (Rivista)