http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/ID171451

Characterization of the (GAAA) microsatellite region in the plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia. (Articolo in rivista)

Type

Label

Characterization of the (GAAA) microsatellite region in the plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia. (Articolo in rivista) (literal)

Anno

Alternative label

De Luca F., Reyes A., Veronico P., Di Vito M., Lamberti F., De Giorgi C. (2002)
Characterization of the (GAAA) microsatellite region in the plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia.
in Gene (Amst.)
(literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

De Luca F., Reyes A., Veronico P., Di Vito M., Lamberti F., De Giorgi C. (literal)

Pagina inizio

Pagina fine

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

Rivista

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#descrizioneSinteticaDelProdotto

I microsatellites sono fra i piu' importanti markers genetici in biologia. Sono state usate sequenze di DNA per caratterizzare un locus variabile di microsatelliti (GAAA) nel nematode Meloidogyne artiellia. L'use di primers vicini a microsatelliti ha dato quattro prodotti di amplificazione definiti sulla base di criteri convenzionali. Le sequenze di questi prodotti hanno rivealato la presenza din nuove varianti nella populazione per via della variabilità delle sequenze. L'insieme di electromorphs e polimorfismi delle sequenze ha dato un totale di sei varianti. L'elevato grado di variabilità nella regione contenente il microsatellite region è dovuto non solo alla variazione nel numero di tetranucleotidi in repeats ma anche alla variazione (lunghezza e variazione per sito) nelle regioni fiancheggianti il microsatellite. Questa ricerca mostra che, nonostante l'omoplasia, la variabilità delle sequenze fiancheggianti il microsatellite di M. artiellia potrebbe essere usata come marker per ricostruzioni filogenetiche. (literal)

Note

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

-De Luca F., Di Vito M., Veronico P., Lamberti F., Istituto per la Protezione delle Piante, CNR, via Amendola 165/A, 70126, Bari, Italy -Reyes A., Centro di Studio sui Mitocondri e Metabolismo Energetico, CNR, via Amendola 165/A, 70126, Bari, Italy -De Giorgi C., Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Università di Bari, via Orabona 4/A, 70125, Bari, Italy (literal)

Titolo

Characterization of the (GAAA) microsatellite region in the plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia. (literal)

Abstract

Microsatellites have become one of the most powerful genetic markers in biology. We have used DNA sequencing to characterize a highly variable microsatellite (GAAA) locus in the root-knot nematode Meloidogyne artiellia. The use of microsatellite flanking primers produced four amplification products that are defined as electromorphs, based on conventional length criteria. The sequencing of these four amplification products revealed the presence of new variants in the population due to sequence variability. The sum of electromorphs and sequence polymorphisms resulted in a total of six variants. The high degree of variability in the microsatellite containing region is due not only to variation in the number of tetranucleotide repeats but also to variation (length and site variation) in the flanking regions of the microsatellite. These investigations show that, in spite of the size homoplasy, the variability of the microsatellite flanking sequences of M. artiellia could be used as informative markers for phylogenetic reconstructions. (literal)

Prodotto di