Minimal structural requirements for Root effect: Crystal structure of the cathodic hemoglobin isolated from the antarctic fish Trematomus newnesi (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• Minimal structural requirements for Root effect: Crystal structure of the cathodic hemoglobin isolated from the antarctic fish Trematomus newnesi (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2006-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

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• 10.1002/prot.20709 (literal)

Alternative label

• Mazzarella L.; Bonomi G.; Lubrano M.; Merlino A.; Riccio A.; Vergara A.; Vitagliano L.; Verde C.; di Prisco G. (2006)
  Minimal structural requirements for Root effect: Crystal structure of the cathodic hemoglobin isolated from the antarctic fish Trematomus newnesi
  in Proteins (Online)
  (literal)

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• Mazzarella L.; Bonomi G.; Lubrano M.; Merlino A.; Riccio A.; Vergara A.; Vitagliano L.; Verde C.; di Prisco G. (literal)

Pagina inizio

• 316 (literal)

Pagina fine

• 321 (literal)

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• 62 (literal)

Rivista

• Proteins (Rivista)

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• 2 (literal)

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• Pubblicazione su rivista scientifica (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

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• Dipartimento di Chimica, Universita´ degli Studi di Napoli \"Federico II\", Naples, Italy Istituto di Biostrutture e Bioimmagini, CNR, Naples, Italy Centro Regionale di Competenza Bioteknet, Complesso Ristrutturato S. Andrea delle Dame, Naples, Italy Istituto di Biochimica delle Proteine, CNR, Naples, Italy (literal)

Titolo

• Minimal structural requirements for Root effect: Crystal structure of the cathodic hemoglobin isolated from the antarctic fish Trematomus newnesi (literal)

Abstract

• The cathodic hemoglobin component of the Antarctic fish Trematomus newnesi (HbCTn) is a Root-effect protein. The interpretation of its functional properties in relation to its sequence is puzzling. Indeed, HbCTn sequence is characterized by an extremely low histidyl content, and in particular by the lack of His146beta and His69beta, which are believed to be important in Bohr and Root effects, respectively. Furthermore, previous analyses suggested that the local environment of Asp95alpha, Asp99beta, and Asp101beta should not be appropriate for the formation of Asp–Asp interactions, which are important for the Root effect. Here, we report the high-resolution crystal structure of the deoxy form of HbCTn. Our data provide a structural interpretation for the very low oxygen affinity of the protein and insights into the structural determinants of the Root effect protein. The structure demonstrates that the presence of Ile41alpha and Ser97alpha at the alpha1beta2 interface does not prevent the formation of the inter-Asp interactions in HbCTn, as previous studies had suggested. The present data indicate that the hydrogen bond formed between Asp95alpha and Asp101beta, which is stabilized by Asp99beta, is per se sufficient to generate the Root effect, and it is the minimal structural requirement needed for the design of Root-effect Hbs. (literal)

Prodotto di

• Basi molecolari degli adattamenti evolutivi negli organismi polari (TA.P02.006.001) (Modulo)
• Institute of protein biochemistry (IBP) (Istituto)
• Determinazione della struttura tridimensionale di biomolecole complesse con tecniche spettroscopiche e cristallografiche (PM.P01.022.001) (Modulo)
• Institute of biostructure and bioimaging (IBB) (Istituto)

Autore CNR

• VINCENZA VERDE (Unità di personale interno)
• ALESSANDRO VERGARA (Unità di personale esterno)
• Lelio Mazzarella (Persona)
• GUIDO DI PRISCO (Unità di personale interno)
• LUIGI VITAGLIANO (Persona)

Insieme di parole chiave

• Keywords of "Minimal structural requirements for Root effect: Crystal structure of the cathodic hemoglobin isolated from the antarctic fish Trematomus newnesi" (Insieme di parole chiave)

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Autore CNR di

• LUIGI VITAGLIANO (Persona)
• VINCENZA VERDE (Unità di personale interno)
• ALESSANDRO VERGARA (Unità di personale esterno)
• Lelio Mazzarella (Persona)
• GUIDO DI PRISCO (Unità di personale interno)

Prodotto

• Institute of biostructure and bioimaging (IBB) (Istituto)
• Institute of protein biochemistry (IBP) (Istituto)
• Determinazione della struttura tridimensionale di biomolecole complesse con tecniche spettroscopiche e cristallografiche (PM.P01.022.001) (Modulo)
• Basi molecolari degli adattamenti evolutivi negli organismi polari (TA.P02.006.001) (Modulo)

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• Proteins (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Keywords of "Minimal structural requirements for Root effect: Crystal structure of the cathodic hemoglobin isolated from the antarctic fish Trematomus newnesi" (Insieme di parole chiave)