Transcription of Satellite III non-coding RNAs is a general stress response in human cells (Articolo in rivista)

Type

• Prodotto della ricerca (Classe)
• Articolo in rivista (Classe)

Label

• Transcription of Satellite III non-coding RNAs is a general stress response in human cells (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2008-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1093/nar/gkm1056 (literal)

Alternative label

• Valgardsdottir R.(1); Chiodi I.(1); Giordano M.(1); Rossi A.(2); Bazzini S.(1); Ghigna C.(1); Riva S.(1); Biamonti G.(1) (2008)
  Transcription of Satellite III non-coding RNAs is a general stress response in human cells
  in Nucleic acids research
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Valgardsdottir R.(1); Chiodi I.(1); Giordano M.(1); Rossi A.(2); Bazzini S.(1); Ghigna C.(1); Riva S.(1); Biamonti G.(1) (literal)

Pagina inizio

• 423 (literal)

Pagina fine

• 434 (literal)

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• Epub 2007 Nov 26 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 36 (literal)

Rivista

• Nucleic acids research (Rivista)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroFascicolo

• 2 (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#affiliazioni

• 1-Istituto di Genetica Molecolare - Consiglio Nazionale delle Ricerche Via Abbiategrasso 207, 27100 Pavia; 2-Istituto di Neurobiologia e Medicina Molecolare - Consiglio Nazionale delle Ricerche Via Fosso del Cavaliere 100, 00133 Roma (literal)

Titolo

• Transcription of Satellite III non-coding RNAs is a general stress response in human cells (literal)

Abstract

• In heat-shocked human cells, heat shock factor 1 activates transcription of tandem arrays of repetitive Satellite III (SatIII) DNA in pericentromeric heterochromatin. Satellite III RNAs remain associated with sites of transcription in nuclear stress bodies (nSBs). Here we use real-time RT-PCR to study the expression of these genomic regions. Transcription is highly asymmetrical and most of the transcripts contain the G-rich strand of the repeat. A low level of G-rich RNAs is detectable in unstressed cells and a 10(4)-fold induction occurs after heat shock. G-rich RNAs are induced by a wide range of stress treatments including heavy metals, UV-C, oxidative and hyper-osmotic stress. Differences exist among stressing agents both for the kinetics and the extent of induction (>100- to 80.000-fold). In all cases, G-rich transcripts are associated with nSBs. On the contrary, C-rich transcripts are almost undetectable in unstressed cells and modestly increase after stress. Production of SatIII RNAs after hyper-osmotic stress depends on the Tonicity Element Binding Protein indicating that activation of the arrays is triggered by different transcription factors. This is the first example of a non-coding RNA whose transcription is controlled by different transcription factors under different growth conditions. (literal)

Prodotto di

• Institute of molecular genetics (IGM) (Istituto)
• Istituto di neurobiologia e medicina molecolare (INMM) (Istituto)
• Meccanismi ossidoriduttivi nelle patologie degenerative ed infiammatorie (ME.P04.005.003) (Modulo)
• Studio della regolazione post-trascrizionale dell'espressione genica in risposta a stress. Fattori che controllano lo splicing dei mRNA in cellule normali e nei tumori. (SV.P13.001.001) (Modulo)

Autore CNR

• RUT VALGARDSDOTTIR (Persona)
• CLAUDIA GHIGNA (Unità di personale interno)
• SILVANO RIVA (Unità di personale interno)
• GIUSEPPE BIAMONTI (Unità di personale interno)
• ANTONIO ROSSI (Persona)
• ILARIA CHIODI (Unità di personale esterno)
• MANUELA GIORDANO (Persona)

Incoming links:

Prodotto

• Institute of molecular genetics (IGM) (Istituto)
• Istituto di neurobiologia e medicina molecolare (INMM) (Istituto)
• Studio della regolazione post-trascrizionale dell'espressione genica in risposta a stress. Fattori che controllano lo splicing dei mRNA in cellule normali e nei tumori. (SV.P13.001.001) (Modulo)
• Meccanismi ossidoriduttivi nelle patologie degenerative ed infiammatorie (ME.P04.005.003) (Modulo)

Autore CNR di

• GIUSEPPE BIAMONTI (Unità di personale interno)
• SILVANO RIVA (Unità di personale interno)
• ANTONIO ROSSI (Persona)
• CLAUDIA GHIGNA (Unità di personale interno)
• MANUELA GIORDANO (Persona)
• RUT VALGARDSDOTTIR (Persona)
• ILARIA CHIODI (Unità di personale esterno)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• Nucleic acids research (Rivista)