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DmTTF, a novel mitochondrial transcription termination factor that recognises two sequences of Drosophila melanogaster mitochondrial DNA. (Articolo in rivista)

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DmTTF, a novel mitochondrial transcription termination factor that recognises two sequences of Drosophila melanogaster mitochondrial DNA. (Articolo in rivista) (literal)

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Roberti M. 1, Loguercio Polosa P. 1, Bruni F. 1, Musicco C. 2, Gadaleta M.N. 1, 2, Cantatore P. 1, 2 (2003)
DmTTF, a novel mitochondrial transcription termination factor that recognises two sequences of Drosophila melanogaster mitochondrial DNA.
in Nucleic acids research
(literal)

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Roberti M. 1, Loguercio Polosa P. 1, Bruni F. 1, Musicco C. 2, Gadaleta M.N. 1, 2, Cantatore P. 1, 2 (literal)

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Impact factor 7,05 Il nostro è uno dei pochi gruppi al mondo che studia le proteine mitocondriali coinvolte nella regolazione della replicazione e trascrizione del DNA mitocondriale negli invertebrati, campo molto attivo di studio dato il ruolo dei mitocondri nel decidere la vita o la morte delle cellule. Noi siamo da tempo coinvolti nello studio della terminazione della trascrizione del mtDNA che ha un ruolo rilevante nella regolazione dellespressione del genoma mitocondriale negli organismi animali.I fattori di terminazione della trascrizione mitocondriale sinora conosciuti sono mTERF nelluomo e il fattore mtDBP, identificato nel riccio di mare dal nostro laboratorio. (literal)

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Rivista

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Nellarticolo è descritta lidentificazione del fattore DmTTF in Drosophila melanogaster, mediante un approccio bioiformatico, basato sul confronto tra le sequenze amminoacidiche dei fattori di terminazione già noti e quelle contenute in un database di sequenze di D. melanogaster, e la sua caratterizzazione molecolare. I risultati ottenuti indicano che tale proteina è il fattore di terminazione della trascrizione mitocondriale di tale organismo. La Drosophila è stata scelta come sistema modello perché è conosciuta la sequenza del genoma nucleare e mitocondriale e perché è possibile testare leffetto dellalterata espressione genica sia a livello fenotipico che molecolare. (literal)

Note

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1 Dipartimento di biochimica e Biologia Molecolare, Università di Bari, Bari, Italy - 2 Istituto di Biomembrane e Bioenergetica, CNR, Bari Italy (literal)

Titolo

DmTTF, a novel mitochondrial transcription termination factor that recognises two sequences of Drosophila melanogaster mitochondrial DNA. (literal)

Abstract

Using a combination of bioinformatic and molecular biology approaches a Drosophila melanogaster protein, DmTTF, has been identified, which exhibits sequence and structural similarity with two mitochondrial transcription termination factors, mTERF (human) and mtDBP (sea urchin). Import/processing assays indicate that DmTTF is synthesised as a precursor of 410 amino acids and is imported into mitochondria, giving rise to a mature product of 366 residues. Band-shift and DNase I protection experiments show that DmTTF binds two homologous, short, non-coding sequences of Drosophila mitochondrial DNA, located at the 3' end of blocks of genes transcribed on opposite strands. The location of the target sequences coincides with that of two of the putative transcription termination sites previously hypothesised. These results indicate that DmTTF is the termination factor of mitochondrial transcription in Drosophila. The existence of two DmTTF binding sites might serve not only to stop transcription but also to control the overlapping of a large number of transcripts generated by the peculiar transcription mechanism operating in this organism. (literal)

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