Strengthening insights into host responses to mastitis infection in ruminants by combining heterogeneous microarray data sources (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• Strengthening insights into host responses to mastitis infection in ruminants by combining heterogeneous microarray data sources (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2011-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Alternative label

• Genini S., Badaoui B., Sclep G., Bishop S.C., Waddington D., Pinard van der Laan M.H., Klopp C., Cabau C., Seyfert H.M., Petzl W., Jensen K., Glass E.J., de Greeff A., Smith H.E., Smits M.A., Olsaker I., Boman G.M., Pisoni G., Moroni P., Castiglioni B., C (2011)
  Strengthening insights into host responses to mastitis infection in ruminants by combining heterogeneous microarray data sources
  in BMC genomics
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Genini S., Badaoui B., Sclep G., Bishop S.C., Waddington D., Pinard van der Laan M.H., Klopp C., Cabau C., Seyfert H.M., Petzl W., Jensen K., Glass E.J., de Greeff A., Smith H.E., Smits M.A., Olsaker I., Boman G.M., Pisoni G., Moroni P., Castiglioni B., C (literal)

Pagina inizio

• 225 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 12 (literal)

Rivista

• BMC genomics (Rivista)

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• L’Impact Factor di questa rivista è 3,77 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#descrizioneSinteticaDelProdotto

• Nel lavoro viene descritta la meta-analisi compiuta sui dati ottenuti da sei diversi studi sull’espressione genica differenziale in seguito ad infezione della ghiandola mammaria di bovini, ovini e caprini con differenti patogeni, quali S. aureus, E. coli, e S. uberis, al fine di integrare le informazioni di trascrittomica provenienti da diverse fonti eterogenee. La meta-analisi compiuta non solo conferma i risultati ottenuti dai singoli studi, ma evidenzia anche il coinvolgimento di geni e funzioni biologiche non identificati precedentemente. (literal)

Note

• ISI Web of Science (WOS) (literal)

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• GS, BB, SG, GE – PTP, Lodi; BSC, WD, JK, GEJ - Roslin Institute, Edinburgh, UK; PvdLMH - INRA/AgroParisTech, Paris, France; KC, RR - INRA, Castanet-Tolosan Cedex, France; CC - INRA, Nouzilly, France; SHM - Institute for Farm Animal Biology, Dummerstorf, Germany; PW - Clinic for Ruminants, Munich, Germany; dGA, SHE, SMA - Wageningen UR, Lelystad, The Netherlands; OI, BGM - Norwegian School of Veterinary Science, Oslo, Norway; PG, MP – DIPAV-UNIMI, Milano; CB, CP, DM - IBBA-CNR, Lodi; FE, FG - INRA-ENVT, Toulouse, France. (literal)

Titolo

• Strengthening insights into host responses to mastitis infection in ruminants by combining heterogeneous microarray data sources (literal)

Abstract

• Gene expression profiling studies of mastitis in ruminants have provided key but fragmented knowledge for the understanding of the disease. A systematic combination of different expression profiling studies via meta-analysis techniques has the potential to test the extensibility of conclusions based on single studies. Using the program Pointillist, we performed meta-analysis of transcription-profiling data from six independent studies of infections with mammary gland pathogens, including samples from cattle challenged in vivo with S. aureus, E. coli, and S. uberis, samples from goats challenged in vivo with S. aureus, as well as cattle macrophages and ovine dendritic cells infected in vitro with S. aureus. We combined different time points from those studies, testing different responses to mastitis infection: overall (common signature), early stage, late stage, and cattle-specific. This meta-analysis approach reinforces previous findings but also reveals several novel themes, including the involvement of genes, biological functions, and pathways that were not identified in individual studies. As such, it provides an interesting proof of principle for future studies combining information from diverse heterogeneous sources. (literal)

Prodotto di

• Conservazione delle risorse genetiche animali e valorizzazione delle loro produzioni (AG.P01.020.001) (Modulo)
• Institute of agricultural biology and biotechnology (IBBA) (Istituto)

Autore CNR

• BIANCA MARIA ELISABETTA CASTIGLIONI (Unità di personale interno)
• Marcello Del Corvo (Unità di personale esterno)
• PAOLA CREMONESI (Unità di personale interno)

Insieme di parole chiave

• Keywords of "Strengthening insights into host responses to mastitis infection in ruminants by combining heterogeneous microarray data sources" (Insieme di parole chiave)

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Prodotto

• Institute of agricultural biology and biotechnology (IBBA) (Istituto)
• Conservazione delle risorse genetiche animali e valorizzazione delle loro produzioni (AG.P01.020.001) (Modulo)

Autore CNR di

• BIANCA MARIA ELISABETTA CASTIGLIONI (Unità di personale interno)
• Marcello Del Corvo (Unità di personale esterno)
• PAOLA CREMONESI (Unità di personale interno)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• BMC genomics (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Keywords of "Strengthening insights into host responses to mastitis infection in ruminants by combining heterogeneous microarray data sources" (Insieme di parole chiave)