STUDIO DELL'INTERO TRASCRITTOMA E SUA CORRELAZIONE CON L'ASSETTO GENETICO E FENOTIPICO (ME.P07.006.007)

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  • STUDIO DELL'INTERO TRASCRITTOMA E SUA CORRELAZIONE CON L'ASSETTO GENETICO E FENOTIPICO (ME.P07.006.007) (literal)
Codice
  • ME.P07.006.007 (literal)
Anno di chiusura previsto
  • 2014-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
Istituto esecutore
Abstract
  • Il trascrittoma costituisce l'insieme degli RNA trascritti dal genoma. Mentre il genoma è identico all'interno di ogni cellula di un organismo, il trascrittoma varia a seconda del tipo cellulare, dello stadio di maturazione, ed in seguito a stimoli. L'espressione genica costituisce un fenotipo informativo dell'effetto genetico e ambientale sulle cellule. Le teconologie di sequenziamento massivo di ultima generazione (NGS-Next Generation Sequencing) permettono di caratterizzare il trascrittoma in toto, in tempi brevi e con alta risoluzione. Grazie alle NGS è emersa la trascrizione pervasiva del genoma, che ha permesso di identificare inoltre nuovi RNA regolatori. La maggior parte delle variazioni dell'espressione genica è ereditabile. Mettere in correlazione i livelli di espressione e gli splicing alternativi con gli SNP, ovvero il trascrittoma con l'assetto genetico, permetterà l'identificazione di eQTL e sQTL. Proponiamo, nell'ambito del progetto ProgeNIA, lo studio dell trascrittoma di 1000 individui. Caratterizzeremo il trascrittoma dei PBMC (cellule mononucleate del sangue periferico), che verrà poi messo in relazione con i dati genetici e fenotipici. (literal)
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  • STUDIO DELL'INTERO TRASCRITTOMA E SUA CORRELAZIONE CON L'ASSETTO GENETICO E FENOTIPICO (literal)
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