Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)
- Type
- Modulo (Classe)
- Label
- Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005) (literal)
- Prodotto
- Kinematic diffraction on a structure with periodically varying scattering function (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- RGDechi-hCit: alpha v beta 3 Selective Pro-Apoptotic Peptide as Potential Carrier for Drug Delivery into Melanoma Metastatic Cells (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Common Structural Traits across Pathogenic Mutants of the Human Prion Protein and Their Implications for Familial Prion Diseases. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Synthesis and Biological Evaluation of Direct Thrombin Inhibitors Bearing 4-(Piperidin-1-yl)pyridine at the P1 Position with Potent Anticoagulant Activity (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A Molecular Dynamics Simulation-Based Interpretation of Nuclear Magnetic Resonance Multidimensional Heteronuclear Spectra of alpha-Synuclein.Dopamine Adducts (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Modulation excitation spectroscopy adapted to crystallography (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- A novel congenital dysprothrombinemia leading to defective prothrombin maturation (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Common Structural Traits across Pathogenic Mutants of the Human Prion Protein and Their Implications for Familial Prion Diseases (vol 411, pg 700, 2011) (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Structural analysis of protein Z gene variants in patients with foetal losses (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Molecular dynamics simulations to study pathogenic mutations in proteins (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Conformational studies of chiral d-Lys-PNA and achiral PNA system in binding with DNA or RNA through a molecular dynamics approach (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Molecular dynamics simulations of PNA-PNA and PNA-DNA duplexes by the use of new parameters implemented in the GROMACS package: A conformational and dynamics study (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Insights into the mechanism of interaction between trehalose-conjugated beta-sheet breaker peptides and A?(1-42) fibrils by molecular dynamics simulations (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Characterization of Plant Biomass Derived Black Carbon (Biochar) as Soil Amendment by X Ray Powder Diffraction (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- In silico investigation and targeting of amyloid ? oligomers of different size (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Fluorescence study for selecting specific ligands toward HER2 receptor: An example of receptor fragment approach (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- How a beta-D-Glucoside Side Chain Enhances Binding Affinity to Thrombin of Inhibitors Bearing 2-Chlorothiophene as P1 Moiety: Crystallography, Fragment Deconstruction Study, and Evaluation of Antithrombotic Properties (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Structure of matrix metalloproteinase-3 with a platinum-based inhibitor (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Automatic identification of alpha-helices in Patterson maps (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- gamma Sulphate PNA (PNA S): highly selective DNA binding molecule showing promising antigene activity. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Fine Dosage of Antisolvent in the Crystallization of L-Histidine: effect on Polymorphism (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Effects of decoy molecules targeting NF-kappaB transcription factors in Cystic fibrosis IB3-1 cells: Recruitment of NF-kappaB to the IL-8 gene promoter and transcription of the IL-8 gene. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- N-heterocyclic carbene catalysed homoenolate addition to 3-methyl-4-nitro-5-styrylisoxazoles (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- In Vitro Activity of the alpha(v)beta(3) Integrin Antagonist RGDechi-hCit on Malignant Melanoma Cells (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Acylpeptide hydrolase inhibition as targeted strategy to induce proteasomal down-regulation (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Patterson selectivity by modulation-enhanced diffraction. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Effects of decoy molecules targeting NF-kappaB transcription factors in Cystic fibrosis IB3-1 cells: Recruitment of NF-kappaB to the IL-8 gene promoter and transcription of the IL-8 gene. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Gold Nanoparticles Capped by a GC-Containing Peptide Functionalized with an RGD Motif for Integrin Targeting. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Targeting pre-miRNA by Peptide Nucleic Acids: A new strategy to interfere in the miRNA maturation. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Modulation enhanced diffraction: a new tool for solving crystal structures and study solid-state kinetics (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- Evaluation of the anti-angiogenic properties of the new selective aVb3 integrin antagonist RGDechiHCit. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Investigation of the Best Conditions to Obtain c(RGDfK) Peptide on Solid Phase (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Untangling diffraction intensity: modulation enhanced diffraction on ZrO2 powder. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Local Fluctuations and Conformational Transitions in Proteins (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Ab initio protein phasing: the Patterson deconvolution method in SIR2002 (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- RootProf: software for multivariate analysis of unidimensional profiles (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A combined approach for characterisation of fresh and brined vine leaves by X-ray powder diffraction, NMR spectroscopy and direct infusion high resolution mass spectrometry (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Protein crystallography and fragment-based drug design (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Acyl peptide hydrolase inhibition as targeted strategy to induce proteasomal dysfunction (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Automatic alpha-helix identification in Patterson maps (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Codice
- PM.P01.023.005 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2015-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Institute of Crystallography (IC) (Istituto)
- Abstract
- Il modulo si propone di determinare la struttura di biomolecole attraverso tecniche cristallografiche e di simulare le loro funzionalità attraverso l'applicazione della modellistica computazionale. Saranno svolte attività riguardanti: - la cristallizzazione e la risoluzione strutturale per via cristallografica di proteine e addotti proteina-ligando di interesse farmaceutico e bio-tecnologico; - l'applicazione delle più avanzate tecniche di modellistica computazionale per simulare la funzionalità dei modelli strutturali determinati o per predire la struttura di macromolecole biologiche non ancora risolte o di difficile cristallizzazione; - la ricerca di sinergie tra i metodi cristallografici e la modellistica computazionale, al fine ottenere la risoluzione strutturale nei casi più ostici. Saranno effettuati studi riguardanti l'insorgenza di patologie neurodegenerative, la caratterizzazione di target per la terapia anti-tumorale, e la bioremediation. (literal)
- Nome
- Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (literal)
- Descrizione
- Descrizione del modulo "Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)" (Descrizione collaborazioni)
- Modulo di
- Gestore
- ROCCO CALIANDRO (Persona)
Incoming links:
- Modulo
- Istituto esecutore di
- Institute of Crystallography (IC) (Istituto)
- Gestore di
- ROCCO CALIANDRO (Persona)
- Descrizione di
- Descrizione del modulo "Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Applicazione di tecniche cristallografiche e modellistica computazionale per studi strutturali di biomolecole (PM.P01.023.005)" (Descrizione collaborazioni)
- Prodotto di
- Acylpeptide hydrolase inhibition as targeted strategy to induce proteasomal down-regulation (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Acyl peptide hydrolase inhibition as targeted strategy to induce proteasomal dysfunction (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Ab initio protein phasing: the Patterson deconvolution method in SIR2002 (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Evaluation of the anti-angiogenic properties of the new selective aVb3 integrin antagonist RGDechiHCit. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Investigation of the Best Conditions to Obtain c(RGDfK) Peptide on Solid Phase (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Effects of decoy molecules targeting NF-kappaB transcription factors in Cystic fibrosis IB3-1 cells: Recruitment of NF-kappaB to the IL-8 gene promoter and transcription of the IL-8 gene. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Gold Nanoparticles Capped by a GC-Containing Peptide Functionalized with an RGD Motif for Integrin Targeting. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
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- gamma Sulphate PNA (PNA S): highly selective DNA binding molecule showing promising antigene activity. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Untangling diffraction intensity: modulation enhanced diffraction on ZrO2 powder. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
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- Effects of decoy molecules targeting NF-kappaB transcription factors in Cystic fibrosis IB3-1 cells: Recruitment of NF-kappaB to the IL-8 gene promoter and transcription of the IL-8 gene. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
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- Protein crystallography and fragment-based drug design (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- How a beta-D-Glucoside Side Chain Enhances Binding Affinity to Thrombin of Inhibitors Bearing 2-Chlorothiophene as P1 Moiety: Crystallography, Fragment Deconstruction Study, and Evaluation of Antithrombotic Properties (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
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- Common Structural Traits across Pathogenic Mutants of the Human Prion Protein and Their Implications for Familial Prion Diseases (vol 411, pg 700, 2011) (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Structural analysis of protein Z gene variants in patients with foetal losses (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Molecular dynamics simulations to study pathogenic mutations in proteins (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Characterization of Plant Biomass Derived Black Carbon (Biochar) as Soil Amendment by X Ray Powder Diffraction (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)