Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)
- Type
- Modulo (Classe)
- Label
- Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004) (literal)
- Prodotto
- ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Social Database for Biodiversity (Banca dati) (Prodotto della ricerca)
- mirNET: a web-based system for the analysis of miRNA:mRNA regulatory networks (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- CSTminer: a web tool for the identification of coding and noncoding conserved sequence tags through cross-species geneome comparison (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The NonCode aReNA DB: a non-redundant and integrated collection of non-coding RNAs (Abstract/Poster in convegno) (Prodotto della ricerca)
- Mining Spatial Association Rules for Composite Motif Discovery (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1201)
- COSRaptor: a software for large-scale COS identification and polymorphic microsatellite in several plant species and cultivars (Abstract in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1105)
- Sequence analysis of deep sequencing data of viroid-derived small RNAs in plants (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- A bioinformatics workflow for the analysis of transcriptome data generated by deep-sequencing (Abstract/Poster in convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1304)
- On the statistical assessment of classifiers using DNA microarray data (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- UTRdb and UTRsite (RELEASE 2010): a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- PlantPIs--an interactive web resource on plant protease inhibitors (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- ASPicDB: A database resource for alternative splicing analysis (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The LIBI Grid Platform for Bioinformatics (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- ComiRNet - The Database of Predicted miRNA Regulatory Networks (Banca dati) (Prodotto della ricerca)
- Charting the NF-kappaB Pathway Interactome Map (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Social Database for Biodiversity (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Exploring the evolution of coding sequences in metazoan mtDNAs: effects of mutation and selection in Insects and Vertebrates (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- UNDERNOTICED PROBLEM OF UNDERCALL IN 454 SEQUENCING SYSTEM (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Bioinformatics approaches for genomics and post genomics applications of next-generation sequencing (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Deep sequencing analysis of viral short RNAs from an infected Pinot Noir grapevine. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Efficient computation of a geodesic distance approximation in phylogenetic tree space (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Algorithms for tagging and recognizing a large set of samples in highly parallel 454 sequencing (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Mining spatial association rules of multiple co-occurring motifs to discover cis-regulatory modules (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A BIOINFORMATICS WORKFLOW FOR THE ANALYSIS OF NONCODING RNAs FROM DATA GENERATED BY DEEP-SEQUENCING (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- ComiRNet: a database of predicted miRNA:mRNA interactions and regulatory networks (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Version VI of the ESTree db: an improved tool for peach transcriptome analysis (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- nc-aReNA: an integrated bioinformatics platform for non-coding RNA-seq data classification and annotation (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Development of a systems biology infrastructure for mathematical modelling and parameter estimation (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Ontology-based image description oriented to Tissue MicroArray experiments design (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Codice
- SV.P18.004.004 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2018-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Istituto di tecnologie biomediche (ITB) (Istituto)
- Primo anno di attività
- 2009-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Abstract
- ll costante potenziamento degli strumenti di Information Technology (IT) è coinciso, negli anni, con un incremento nella velocità di produzione e della qualità dei dati prodotti nella Life Science (LS), particolarmente in settori quali High Throughput DNA Sequencing. Questa convergenza è fondamentale per la gestione e l'interpretazione dell'enorme quantità di dati prodotti nei settori della Genomica, Trascrittomica e Biodiversità. L'entità e l'eterogeneità dei dati prodotti, e la loro interpretazione, rappresentano la principale criticità del futuro progresso della R&D nella Life Science. Le attività sono: i)sviluppo di strumenti bioinformatici per la gestione dei dati genomici, trascrittomici e di biodiversità; ii)progettazione e sviluppo di nuovi strumenti bioinformatici per l'analisi dei dati di deep-sequencing prodotti dalle diverse piattaforme di sequenziamento e in particolare degli small RNAs; iii)sviluppo di algoritmi per l'analisi di dati metagenomici, generati da esperimenti di deep-sequencing in diversi campioni ambientali. Lo sviluppo degli strumenti di gestione ed analisi dei dati si integrano con le commesse: Genomica funzionale e strutturale, Biodiversità Molecolare (literal)
- Nome
- Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (literal)
- Descrizione
- Descrizione collaborazioni del modulo "Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione del modulo "Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)" (Descrizione modulo)
- Modulo di
- Gestore
- SABINO LIUNI (Unità di personale interno)
Incoming links:
- Prodotto di
- Version VI of the ESTree db: an improved tool for peach transcriptome analysis (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Development of a systems biology infrastructure for mathematical modelling and parameter estimation (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- PlantPIs--an interactive web resource on plant protease inhibitors (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Mitonuc: a database of nuclear genes coding for mitochondrial proteins. Update 2002 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Bioinformatics approaches for genomics and post genomics applications of next-generation sequencing (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Deep sequencing analysis of viral short RNAs from an infected Pinot Noir grapevine. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- ASPicDB: A database resource for alternative splicing analysis (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- UTRdb and UTRsite (RELEASE 2010): a collection of sequences and regulatory motifs of the untranslated regions of eukaryotic mRNAs (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Ontology-based image description oriented to Tissue MicroArray experiments design (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Social Database for Biodiversity (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Exploring the evolution of coding sequences in metazoan mtDNAs: effects of mutation and selection in Insects and Vertebrates (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- UNDERNOTICED PROBLEM OF UNDERCALL IN 454 SEQUENCING SYSTEM (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Efficient computation of a geodesic distance approximation in phylogenetic tree space (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Algorithms for tagging and recognizing a large set of samples in highly parallel 454 sequencing (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Mining spatial association rules of multiple co-occurring motifs to discover cis-regulatory modules (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A BIOINFORMATICS WORKFLOW FOR THE ANALYSIS OF NONCODING RNAs FROM DATA GENERATED BY DEEP-SEQUENCING (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- COSRaptor: a software for large-scale COS identification and polymorphic microsatellite in several plant species and cultivars (Abstract in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1105)
- The LIBI Grid Platform for Bioinformatics (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- Mining Spatial Association Rules for Composite Motif Discovery (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1201)
- Sequence analysis of deep sequencing data of viroid-derived small RNAs in plants (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- A bioinformatics workflow for the analysis of transcriptome data generated by deep-sequencing (Abstract/Poster in convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1304)
- ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Social Database for Biodiversity (Banca dati) (Prodotto della ricerca)
- CSTminer: a web tool for the identification of coding and noncoding conserved sequence tags through cross-species geneome comparison (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Charting the NF-kappaB Pathway Interactome Map (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- mirNET: a web-based system for the analysis of miRNA:mRNA regulatory networks (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- On the statistical assessment of classifiers using DNA microarray data (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- ComiRNet - The Database of Predicted miRNA Regulatory Networks (Banca dati) (Prodotto della ricerca)
- ComiRNet: a database of predicted miRNA:mRNA interactions and regulatory networks (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- nc-aReNA: an integrated bioinformatics platform for non-coding RNA-seq data classification and annotation (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The NonCode aReNA DB: a non-redundant and integrated collection of non-coding RNAs (Abstract/Poster in convegno) (Prodotto della ricerca)
- Modulo
- Gestore di
- SABINO LIUNI (Unità di personale interno)
- Istituto esecutore di
- Istituto di tecnologie biomediche (ITB) (Istituto)
- Descrizione di
- Descrizione collaborazioni del modulo "Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione del modulo "Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Metodologie bioinformatiche e banche dati biologiche (SV.P18.004.004)" (Descrizione stato avanzamento attività)