Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)

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  • Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001) (literal)
Prodotto
Codice
  • PM.P07.009.001 (literal)
Anno di chiusura previsto
  • 2011-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
Istituto esecutore
Primo anno di attività
  • 2009-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
Abstract
  • Utilizzando metodi di calcolo quantomeccanici verrà completata la caratterizzazione di intermedi reattivi nella HorseRadish Peroxidase (HRP), sia per lo stato fondamentale che per i primi stati ecciati elettronicamente. Le reazione enzimatiche, alla base di biosensori, verranno modellizzate con metodi ibridi di tipo perturbativo. E' necessario pero' estendere la scala temporale del processo dinamico eseguendo un sampling esteso dello spazio delle configurazioni con l'inclusione dell'ambiemte proteico e del solvente. Inoltre molte biomolecole sono ad alto spin: in questo caso la Density Functional Theory (DFT) non riesce a risolvere correttamente la configurazione elettronica e si prevede l'utilizzo di metodi a funzione d'onda (Interazione di Configurazioni). La deposizione di molecole complesse su superficie di metalli o semiconduttori sarà presa in considerazione attraverso studi di dinamica molecolare classica e ab initio (i.e. Car-Parrinello) con l'obiettivo di comprendere sia il fenomeno di \"self assembling\", in collaborazione con altri moduli della commessa, che la modellizzazione dell'interazione enzima-superficie per studiarne l'effetto sulla reattivita' dell'enzima. (literal)
Nome
  • Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (literal)
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