Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)
- Type
- Modulo (Classe)
- Label
- Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001) (literal)
- Prodotto
- Supramolecular interactions of chiral molecules at the surface (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Adsorption and self-assembly of D-alaninol on Cu(100) (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- On the Catalytic Role of Structural Fluctuations in Enzyme Reactions: Computational Evidences in the formation of Compound 0 in Horseradish Peroxidase (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Compound I in HRP enzyme: Magnetic assessment by Quadratic Configuration Interaction calculations. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Multiple computational approach to model enzymatic reaction: the HRP as a case study. (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The role of Arginine 38 in HRP enzyme revisited: a computational investigation (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Nuove prospettive per i semiconduttori organici molecolari da studi 'in silico' (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- On the formation of HRP compound I At high pH: new insight from ab initio molecular dynamics (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Codice
- PM.P07.009.001 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2011-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Primo anno di attività
- 2009-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Abstract
- Utilizzando metodi di calcolo quantomeccanici verrà completata la caratterizzazione di intermedi reattivi nella HorseRadish Peroxidase (HRP), sia per lo stato fondamentale che per i primi stati ecciati elettronicamente. Le reazione enzimatiche, alla base di biosensori, verranno modellizzate con metodi ibridi di tipo perturbativo. E' necessario pero' estendere la scala temporale del processo dinamico eseguendo un sampling esteso dello spazio delle configurazioni con l'inclusione dell'ambiemte proteico e del solvente. Inoltre molte biomolecole sono ad alto spin: in questo caso la Density Functional Theory (DFT) non riesce a risolvere correttamente la configurazione elettronica e si prevede l'utilizzo di metodi a funzione d'onda (Interazione di Configurazioni). La deposizione di molecole complesse su superficie di metalli o semiconduttori sarà presa in considerazione attraverso studi di dinamica molecolare classica e ab initio (i.e. Car-Parrinello) con l'obiettivo di comprendere sia il fenomeno di \"self assembling\", in collaborazione con altri moduli della commessa, che la modellizzazione dell'interazione enzima-superficie per studiarne l'effetto sulla reattivita' dell'enzima. (literal)
- Nome
- Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (literal)
- Descrizione
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione del modulo "Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)" (Descrizione modulo)
- Modulo di
- Gestore
- AMEDEO PALMA (Persona)
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- Prodotto di
- Supramolecular interactions of chiral molecules at the surface (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- On the Catalytic Role of Structural Fluctuations in Enzyme Reactions: Computational Evidences in the formation of Compound 0 in Horseradish Peroxidase (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The role of Arginine 38 in HRP enzyme revisited: a computational investigation (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Compound I in HRP enzyme: Magnetic assessment by Quadratic Configuration Interaction calculations. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- On the formation of HRP compound I At high pH: new insight from ab initio molecular dynamics (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Nuove prospettive per i semiconduttori organici molecolari da studi 'in silico' (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Adsorption and self-assembly of D-alaninol on Cu(100) (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Multiple computational approach to model enzymatic reaction: the HRP as a case study. (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Modulo
- Istituto esecutore di
- Gestore di
- AMEDEO PALMA (Persona)
- Descrizione di
- Descrizione collaborazioni del modulo "Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione del modulo "Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Modellizzazione di reazioni enzimatiche e della interazione di molecole con superfici . (PM.P07.009.001)" (Descrizione stato avanzamento attività)