Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)
- Type
- Modulo (Classe)
- Label
- Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001) (literal)
- Prodotto
- Gadd45 beta forms a homodimeric complex that binds tightly to MKK7 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Computational and Spectroscopic integrated study of b-helix structures: a model for supramolecular interaction of nanotubes in solution. (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Ring Constraint Cyclic Peptidomimetics: A Chemical Model to Study Helices and Macrocycles (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Carbonic anhydrase inhibitors: bioreductive nitro-containing sulfonamides with selectivity for targeting the tumor associated isoforms IX and XII. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Structural analysis of BldR from Sulfolobus solfataricus provides insights into the molecular basis of transcriptional activation in Archaea by MarR family proteins (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Molecular modeling and functional characterization of the monomeric primase-polymerase domain from the Sulfolobus solfataricus plasmid pIT3. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Structural features of distinctin affecting peptide biological and biochemical properties (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Rare casbane diterpenoids from Hainan soft coral Sinularia depressa. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Probing membrane topology of the antimicrobial peptide distinctin by solid-state NMR spectroscopy in zwitterionic and charged lipid bilayers. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- INSIGHTS INTO THE MOLECULAR BASIS OF TRANSCRIPTION ACTIVATION IN ARCHAEA: STRUCTURAL ANALYSIS OF BldR FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Gadd45beta dimerization does not affect MKK7 binding (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Peptidi ciclici che legano il recettore CXCR4 e relativi usi in campo medico e diagnostico (Brevetto) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1601)
- Self-association regions in the CARD of Bcl-10 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A SPR strategy for high-throughput ligand screenings based on synthetic peptides mimicking a selected subdomain of the target protein: A proof of concept on HER2 receptor (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- CARBONIC ANHYDRASE INHIBITORS: COMPARISON OF ALIPHATIC SULFAMATE/BIS-SULPHAMATE ADDUCTS WITH ISOZYMES II AND IX (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- In vitro and in vivo functional characterization of new cycle-peptides inhibitors for C-X-C chemokine receptor-4 (CXCR4) (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- DESIGN, SYNTHESIS AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF NEW PEPTIDES (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- IN VITRO AND IN VIVO FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF NEW CYCLE-PEPTIDES INHIBITORS FOR C-X-C CHEMOKINE RECEPTOR-4 (CXCR4) (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Cold denaturation and aggregation: a comparative NMR study of titin I28 in bulk and in a confined environment (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- FUNCTIONAL ASSAYS TO TEST CXCR4-INTERACTING NEW SYNTHESIZED PEPTIDIC (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Codice
- PM.P07.008.001 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2010-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Institute of biomolecular chemistry (ICB) (Istituto)
- Primo anno di attività
- 2009-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Abstract
- Il modulo si propone di operare nell'ambito dello sviluppo e applicazione di metodi bioinformatici e computazionali basati sull'integrazione di dati sperimentali derivanti da tecniche NMR in soluzione, di microscopia ottica/elettronica, di spettrometria di massa, spettroscopiche e biochimiche, e orientati: - all'ottenimento di modelli teorici di sistemi proteici più robusti ed accurati di quelli attualmente derivabili da tecniche di modellazione standard (TC_BioInf/HM/MD,TS_MS-Bioch); - alla caratterizzazione strutturale e analisi conformazionale da dati NMR di molecole di natura organica o peptidica (TC_QM/FF/Sampl,TS_NMR); - all'ottenimento di complessi teorici ligando-proteina mediante integrazione di dati sperimentali e tecniche di screening in silico, allo scopo di determinarne la modalità di legame e proporre modifiche chimiche mirate all'ottimizzazione dell'attività biologica del ligando considerato (TC_HM/MD/Dock,TS_MS-Bioch); - alla caratterizzazione di sistemi molecolari a struttura non canonica o con organizzazione supramolecolare (PS_NonCanStr); - alla caratterizzazione e progettazione di molecole con proprietà biologico/farmacologiche notevoli (PS_BioAct). (literal)
- Nome
- Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (literal)
- Descrizione
- Descrizione del modulo "Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)" (Descrizione collaborazioni)
- Modulo di
- Gestore
- ROSA MARIA VITALE (Unità di personale interno)
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- Modulo
- Gestore di
- ROSA MARIA VITALE (Unità di personale interno)
- Istituto esecutore di
- Institute of biomolecular chemistry (ICB) (Istituto)
- Descrizione di
- Descrizione del modulo "Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Sviluppo ed applicazione di protocolli computazionali per la predizione e determinazione strutturale di biomolecole e loro complessi. (PM.P07.008.001)" (Descrizione collaborazioni)
- Prodotto di
- Rare casbane diterpenoids from Hainan soft coral Sinularia depressa. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Gadd45 beta forms a homodimeric complex that binds tightly to MKK7 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Cold denaturation and aggregation: a comparative NMR study of titin I28 in bulk and in a confined environment (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Molecular modeling and functional characterization of the monomeric primase-polymerase domain from the Sulfolobus solfataricus plasmid pIT3. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Ring Constraint Cyclic Peptidomimetics: A Chemical Model to Study Helices and Macrocycles (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- IN VITRO AND IN VIVO FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF NEW CYCLE-PEPTIDES INHIBITORS FOR C-X-C CHEMOKINE RECEPTOR-4 (CXCR4) (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- FUNCTIONAL ASSAYS TO TEST CXCR4-INTERACTING NEW SYNTHESIZED PEPTIDIC (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- DESIGN, SYNTHESIS AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF NEW PEPTIDES (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- INSIGHTS INTO THE MOLECULAR BASIS OF TRANSCRIPTION ACTIVATION IN ARCHAEA: STRUCTURAL ANALYSIS OF BldR FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Computational and Spectroscopic integrated study of b-helix structures: a model for supramolecular interaction of nanotubes in solution. (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- CARBONIC ANHYDRASE INHIBITORS: COMPARISON OF ALIPHATIC SULFAMATE/BIS-SULPHAMATE ADDUCTS WITH ISOZYMES II AND IX (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- In vitro and in vivo functional characterization of new cycle-peptides inhibitors for C-X-C chemokine receptor-4 (CXCR4) (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Peptidi ciclici che legano il recettore CXCR4 e relativi usi in campo medico e diagnostico (Brevetto) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1601)
- Probing membrane topology of the antimicrobial peptide distinctin by solid-state NMR spectroscopy in zwitterionic and charged lipid bilayers. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Structural analysis of BldR from Sulfolobus solfataricus provides insights into the molecular basis of transcriptional activation in Archaea by MarR family proteins (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Self-association regions in the CARD of Bcl-10 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Gadd45beta dimerization does not affect MKK7 binding (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Structural features of distinctin affecting peptide biological and biochemical properties (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A SPR strategy for high-throughput ligand screenings based on synthetic peptides mimicking a selected subdomain of the target protein: A proof of concept on HER2 receptor (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Carbonic anhydrase inhibitors: bioreductive nitro-containing sulfonamides with selectivity for targeting the tumor associated isoforms IX and XII. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)