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Modellistica Molecolare e GRID computing (INT.P02.011.001)
- Type
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- Modellistica Molecolare e GRID computing (INT.P02.011.001) (literal)
- Prodotto
- Genome-wide microRNA target gene identification and annotation using multiple prediction algorithms (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Towards an integrative model for the calcium role in the neurodegenerative diseases (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A mathematical model of the glycolysis in cancer conditions (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Grid Based Application For SNPs Genome Wide Studies (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genome-wide MicroRNA target gene identification and functional characterization. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- myMIR: a genome-wide microRNA targets identification and annotation tool (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A web portal for management of biological data and applications. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Nuclear receptors database for predictive toxicity of EDC. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Exploitation of a 3D-oriented ontology for choosing the representative proteins ion protein surfaces comparison. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Parallel Workflow for the Reconstruction of Molecular Surfaces (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- BIOINFOGRID: Bioinformatics Simulation and Modeling based on GRID (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Biological database access and integration using Web Services in GRID technology (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- High Performance GRID Based Implementation for Genomics and Protein Analysis (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Whole genome scan salt-sensitivity and response to diuretic treatment in essential hypertension. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Comparison of diffenet methods to control for stratification in genome-wide association studies. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- TMAinspect, an EGEE Framework for Tissue MicroArray image handling. Modern computer tools for the biosciences. MBIO08 - International Conference CCGrid 2008 22 may 2008, Lyon, France. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Grid oriented evolution strategy to approach the parameter estimation problem in System Biology models. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- GC-rich special short sequences dominate eukaryotic promoter regions. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Grid methodology for identifying co-regulated genes and transcription factor binding sites (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Enabling parallel TMA image analysis in a grid environment (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Bayesian phylogeny on grid (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Parameters estimation for cell cycle ODE models using high performance computing (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Multiscale approach to Genome-Wide Association studies: network structure, linkage disequilibrium blocks, genes and pathways (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Using SKOS to formalize parameter estimation in systems biology (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- A pipeline for saturation mutagenesis and docking, applied to the endothelial protein C receptor . (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- High Performance Computing Infrastructures for Genetic Linkage Analysis (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- A systems biology analysis of the entry of resting mammalian cells into S phase. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Comparison of different methods to estimate genetic ancestry and control for stratification in genome-wide association studies. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genome wide linkage analysis using SNPs in high performance distributed environments. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Development of a new predictive algorithm for drug response. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- 3D-Structure Prediction of the Modular Protein Sialoadhesin Using a Multi-step Modelling Strategy (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genes-to-Systems Breast Cancer (G2SBC) Database: a data integration approach for breast cancer research oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Pipeline for saturation mutagenesis and docking screening in the study of protein-ligand interaction: the Endothelial Protein C Receptor (EPCR) (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A stochastic, discrete model for the simulation of the action potential. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Stratification correction in genome-wide association studies. SysBioHealth 2008 (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Visualization ToolKit Based Application for Representing Macromolecular Surfaces. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Modelling Spatial Heterogeneity and Macromolecular Crowding with Membrane Systems (Curatela) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1501)
- An Unusual Distribution of 6-nt Sequences Near The Transcription Start Site. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Tissue-Specific approach for automatic pathological areas identification in tissue micorarray images. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Representation and Modelling of Protein Surface Determinants (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Modelling of protein surface to identify and analyze functional determinants using GRID technologies (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- The BrainGeneExpress Database: a data integration approach for neuroinformatic research oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Gene Nerve Cell DB: a data integration approach for neuroinformatics research oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Comparison of protein-protein algorithms for the study of Proteinase-3 Endothelial Protein C Receptor complex. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Metadata and Semantic Research, Ch. Ontological Enrichment of the Genes-to-Systems Breast Cancer Database (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1201)
- Reverse molecular docking and pathway analysis for the identification of protein targets and pathways of endocrine disruptor Bisphenol A (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Bioinformatics infrastructure for the analysis of the relationships between particulate matter and human health. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Piattaforma bioinformatica per lo studio della relazione tra particolato atmosferico e salute umana. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Molecular modeling of the ligand binding domain of human Aryl hydrocarbon Receptor (AhR) and its interaction with 2,3,7,8-TCDD (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Realizzazione di una banca dati strutturale dei recettori nucleari umani per la predizione della tossicità dei distruttori endocrini. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Sys-Bio Gateway: a framework of bioinformatics database resources oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Parallel Algorithm for Molecular Surface Matching Through Image Representation. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Complex Search, Ranks, and Biological Discovery: A User's Perspective (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Nervous System Database (NSD): data integration spanning molecular and system levels (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Molecular dynamics simulations of a small membrane channel: A distributed computing approach (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Towards a nucleo/cytoplasmic model of the G1 to S transition in mammalian cells (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Distributed, High-Performance and Grid Computing in Computational Biology (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- ICT and GRID computing for Bioinformatics and Systems Biology (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- High Performance Implementation for Protein Domain Search using the GRID Platform (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Using Parallel Isosurface Extraction in Superficial Molecular Modeling (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Bioinformatics Workflow using ASSIST on GRID (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- An agent approach for protein function analysis in a grid infrastructure (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Genetic Linkage analysis challenges on a distributed Grid environment. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The Human EST Ontology Explorer: a tissue-oriented visualisation system for ontologies distribution in human EST collections. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- A Parallel Protein Surface Reconstruction System (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The BreastCancerDB: a data integration approach for breast cancer research oriented to systems biology . (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Data management for SNP genotyping technologies (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Parallel Workflow for the Reconstruction of Molecular Surfaces (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- Ancestry correction in genome-wide association studies using stratification methodologies (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- CYCLONET: An integrated Database on Cell Cycle regulation and carcinogenesis. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Tissue MicroArray: a distributed Grid approach for image analysis. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Evaluating mixed HTC/cloud approaches for parameter sweep applications in systems biology (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- The misuse of terms in scientific literature. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Ontology-oriented retrieval of putative microRNAs in Vitis vinifera via GrapeMiRNA: a web database of de novo predicted grape microRNAs (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Whole Genome Scan on schizophrenia in 2 Arab Israeli Samples (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Modelling Cell Cycle Regulation Using Hybrid Automata (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genomics and biomedical data management system (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Docking Procedure for the identification of potential Bisphenol A protein targhets and characterization of the major environmental matrix involved in their pathways (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Repository for the management of tandem MS data (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Characterization of the molecular organization and structural stability of an Arginine-binding protein in Thermotoga maritima. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Analisi in Silico dei Meccanismi dAzione (MOA) correlati allesposizione da Particolato Atmosferico: esame critico del caso del Bisfenolo A. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genetic Linkage Analysis on the Desktop Grid Infrastructure. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Reverse Molecular Docking for the identification of protein targets and pathways of endocrine disruptor Bisphenol A. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A parallel implementation of Genetic Algorithms for parameters estimation of Molecular Surfaces similarity analysis. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Reconstructing networks of pathways via significance analysis of their intersections (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Parameter Estimation for Cell Cycle Ordinary Differential Equation (ODE) Models using a Grid Approach (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Using secondary structure information to perform multiple alignment (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- systems biology analysis of the entry of resting mammalian cells into S phase. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Hybrid Automata for Modelling Cellular Proliferation and Apotosis. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Genome Wide Linkage Analysis and Systems Knowledge: an Integrated Web Framework for Distributed Execution and Results Annotation. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Grid docking simulation for comparative ligand binding of Neurominidase structures (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Amino Acids Surface Patterns in Protein Domain functionality Analysis (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- 3D-protein C mutation database: integration of structural, functional and clinical data of natural Protein C mutants (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Special section on Grid, Web Services, Software Agents and Ontology applications for life sciences. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Semi-automatic identification of punching areas for tissue microarray building: the tubular breast cancer pilot study (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- An Unusual Distribution of 6-nt Sequences Near The Transcription Start Site. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- SNPRanker: a tool for identification and scoring of SNPs associated to target genes. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Genetic linkage analysis challenge on a distributed Grid environment (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- An Agent Approach for Protein Function Analysis in a Grid Infrastructure (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- BGBlast: a BLAST grid implementation with database self-updating and adaptive (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Network integration of data and analysis of oncology interest, (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Parallel Decomposition of 3D Surfaces in Images of Local Descriptors for Molecular Screening (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Grid Powered Genome Wide Studies On Atrial Flutter (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- The role of High Performance Computing in Bioinformatics (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Visualization ToolKit Based Application for Representing Macromolecular Surfaces (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Towards a systems biology approach to mammalian cell cycle: modeling the entrance into S phase of quiescent fibroblasts after serum stimulation (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Identification of functionally related genes using data mining and data integration: a breast cancer case study (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A systems biology approach for the identification of glycolysis key regulators in cancer cells (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Calcium kidney stones are associated with a haplotype of the calcium-sensing receptor gene regulatory region (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Molecular remodeling of potassium channels in fibroblasts from centenarians: A marker of longevity? (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- GAME: A Generic Architecture based on Multiple Experts for Predicting Protein Structures (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A multilevel data integration resource for breast cancer study (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Trends in modeling Biomedical Complex Systems. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Ontology-based, Tissue MicroArray oriented, image centered tissue bank (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Guest editorial: Special section on grid, web services, software agents, and ontology applications for life sciences (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- SYMBIOmatics: Synergies in Medical Informatics and Bioinformatics - exploring current scientific literature for emerging topics (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- MASSP3: A System for Predicting Protein Secondary Structure (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- System for Expressed Sequence Tags, Mapping on Genomic Sequences. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Mining the Bovine Genome with the Bovine SNP Retriever (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Experimenting Grid Protocols to improve privacy preservation in efficient distributed image processing (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Reconstructing networks of pathways via significance analysis of their intersections (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- from gene expression time series: characterization of correlation patterns. International (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Medical informatics and bioinformatics: A bibliometric study (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Experimenting Grid Protocols to improve privacy preservation in efficient distributed image processing (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1201)
- A Parallel Workflow for the Reconstruction of Molecular Surfaces (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Computational and experimental approaches to characterize the molecular organization and structural stability of an Arginine-binding protein from Thermotoga maritima (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- ESTuber db: an online database for Tuber borchii EST sequences (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Multi-level data integration and data mining in systems biology (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- A novel variant of tissue P Systems for the modelling of biochemical systems (Curatela) (Prodotto della ricerca)
- Sys-bio gateway: A framework of bioinformatics database resources oriented to systems biology (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- The role of iron in mitochondrial function (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Biobanking semantic Multilanguage concepts management web system. (Rapporti progetti di ricerca) (Prodotto della ricerca)
- Amino acid transport in thermophiles: characterization of an arginine-binding protein in Thermotoga maritima. 2. Molecular organization and structural stability (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- In silico saturation mutagenesis and docking screening for the analysis of protein-ligand interaction: the Endothelial Protein C Receptor case study (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A distributed approach for parameter estimation in Systems Biology models (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A HPC and Grid Enabling Framework for Genetic Linkage Analysis of SNPs (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Novel members of the family Micromonosporaceae, Rugosimonospora acidiphila gen. nov., sp. nov. and Rugosimonospora africana sp. nov. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Grid Based Genome Wide Studies on Atrial Flutter. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- SNPLims: A Data Management System for Genome Wide Association Studies (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Virtual screening on large scale grids (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Networks from gene expression time series: Characterization of correlation patterns (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- ASPD (Artificially Selected Proteins/Peptides Database): a database of proteins and peptides evolved in vitro (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A Data Integration Approach for Cell Cycle Analysis oriented to Model Simulation in Systems Biology (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The Cell Cycle DB: a systems biology approach to cell cycle analysis (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A fast job scheduling system for a wide range of bioinformatic applications (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- BGBlast: a BLAST grid implementation with database self-updating and adaptive (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A Generic Architecture based on Multiple Experts for Predicting Protein Structures. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Biowep: a workflow enactment portal for bioinformatics applications (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Virtual screening pipeline and ligand modelling for H5N1 neuraminidase (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The Human EST Ontology Explorer: a tissue-oriented visualization system for ontologies distribution in human EST collections (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Identification and computationally-based structural interpretation of naturally occurring variants of human protein C. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- RSSsite: a reference database and prediction tool for the identification of cryptic Recombination Signal Sequences in human and murine genomes (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Structural thermal adaptation of b-tubulins from the Antarctic psychrophilic protozoan Euplotes focardii (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Nuclear Receptors Database for predictive toxicity of EDC (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- CNR Bioinformatics (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- ProCMD: a database and 3D web resource for protein C mutants. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- CYCLONET - an integrated database on cell cycle regulation and carcinogenesis (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Medical Informatics and Bioinformatics (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Computational analysis of mutation spectra. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Ontology-based, Tissue MicroArray oriented, image centred tissue bank (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- An agent-based multilayer architecture for bioinformatics grids (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Image based system for surface matching in macromolecular screening (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The role of microRNA in epithelial to mesenchymal transition. (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- Agents in bioinformatics, computational and systems biology. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Modelling the interaction of steroid receptors with endocrine disrupting chemicals (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Codice
- INT.P02.011.001 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2015-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Abstract
- I metodi computazionali che consentono di predire la struttura proteica e di modellare le variazioni amminoacidiche note in specifiche patologie, costituiscono un importante approccio per la delucidazione dei meccanismi molecolari che determinano l'insorgenza della malattia.
In assenza di strutture sperimentali, i modelli molecolari rappresentano un utile materiale di studio per la comprensione delle relazioni morfo-funzionali e dei meccanismi molecolari alla base della funzione proteica. Essi possono essere sottoposti a simulazioni computazionali in grado di rivelare proprietà chimico-fisiche e dinamiche per una comparazione tra proteine normali e corrispondenti varianti. Sono inoltre utilizzabili per studi di interazione con ligandi che si basano di metodi di docking molecolare allo scopo di definire le proprietà di binding di composti naturali e di composti esogeni con azione farmacologia o di interferenza metabolica. Ci si propone quindi di applicare questi approcci per lo studio di diversi sistemi biologici che includono proteine coinvolte nei processi coagulativi, recettori ormonali, proteine virali, galattosemia. Queste tecniche si baseranno su HPC e GRID Computin (literal)
- Nome
- Modellistica Molecolare e GRID computing (literal)
- Descrizione
- Modulo di
- Gestore
Incoming links:
- Prodotto di
- GAME: A Generic Architecture based on Multiple Experts for Predicting Protein Structures (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Representation and Modelling of Protein Surface Determinants (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Modelling of protein surface to identify and analyze functional determinants using GRID technologies (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- The BrainGeneExpress Database: a data integration approach for neuroinformatic research oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Gene Nerve Cell DB: a data integration approach for neuroinformatics research oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Comparison of protein-protein algorithms for the study of Proteinase-3 Endothelial Protein C Receptor complex. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- 3D-Structure Prediction of the Modular Protein Sialoadhesin Using a Multi-step Modelling Strategy (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genes-to-Systems Breast Cancer (G2SBC) Database: a data integration approach for breast cancer research oriented to systems biology. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Pipeline for saturation mutagenesis and docking screening in the study of protein-ligand interaction: the Endothelial Protein C Receptor (EPCR) (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A stochastic, discrete model for the simulation of the action potential. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Stratification correction in genome-wide association studies. SysBioHealth 2008 (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Visualization ToolKit Based Application for Representing Macromolecular Surfaces. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- An Unusual Distribution of 6-nt Sequences Near The Transcription Start Site. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Tissue-Specific approach for automatic pathological areas identification in tissue micorarray images. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Multiscale approach to Genome-Wide Association studies: network structure, linkage disequilibrium blocks, genes and pathways (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Using SKOS to formalize parameter estimation in systems biology (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- A pipeline for saturation mutagenesis and docking, applied to the endothelial protein C receptor . (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- High Performance Computing Infrastructures for Genetic Linkage Analysis (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- A systems biology analysis of the entry of resting mammalian cells into S phase. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Comparison of different methods to estimate genetic ancestry and control for stratification in genome-wide association studies. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genome wide linkage analysis using SNPs in high performance distributed environments. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Development of a new predictive algorithm for drug response. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Whole genome scan salt-sensitivity and response to diuretic treatment in essential hypertension. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Comparison of diffenet methods to control for stratification in genome-wide association studies. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- TMAinspect, an EGEE Framework for Tissue MicroArray image handling. Modern computer tools for the biosciences. MBIO08 - International Conference CCGrid 2008 22 may 2008, Lyon, France. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Grid oriented evolution strategy to approach the parameter estimation problem in System Biology models. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- GC-rich special short sequences dominate eukaryotic promoter regions. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Enabling parallel TMA image analysis in a grid environment (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Bayesian phylogeny on grid (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Parameters estimation for cell cycle ODE models using high performance computing (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A Parallel Workflow for the Reconstruction of Molecular Surfaces (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- BIOINFOGRID: Bioinformatics Simulation and Modeling based on GRID (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Biological database access and integration using Web Services in GRID technology (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- High Performance GRID Based Implementation for Genomics and Protein Analysis (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genome-wide MicroRNA target gene identification and functional characterization. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A web portal for management of biological data and applications. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Nuclear receptors database for predictive toxicity of EDC. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Exploitation of a 3D-oriented ontology for choosing the representative proteins ion protein surfaces comparison. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Genome-wide microRNA target gene identification and annotation using multiple prediction algorithms (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Towards an integrative model for the calcium role in the neurodegenerative diseases (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- A mathematical model of the glycolysis in cancer conditions (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Grid Based Application For SNPs Genome Wide Studies (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- An Unusual Distribution of 6-nt Sequences Near The Transcription Start Site. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- SNPRanker: a tool for identification and scoring of SNPs associated to target genes. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Genetic linkage analysis challenge on a distributed Grid environment (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- systems biology analysis of the entry of resting mammalian cells into S phase. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Hybrid Automata for Modelling Cellular Proliferation and Apotosis. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Genome Wide Linkage Analysis and Systems Knowledge: an Integrated Web Framework for Distributed Execution and Results Annotation. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
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- Amino Acids Surface Patterns in Protein Domain functionality Analysis (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
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- Parameter Estimation for Cell Cycle Ordinary Differential Equation (ODE) Models using a Grid Approach (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
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- A parallel implementation of Genetic Algorithms for parameters estimation of Molecular Surfaces similarity analysis. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
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- A Visualization ToolKit Based Application for Representing Macromolecular Surfaces (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
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- An Agent Approach for Protein Function Analysis in a Grid Infrastructure (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- BGBlast: a BLAST grid implementation with database self-updating and adaptive (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Network integration of data and analysis of oncology interest, (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Genetic Linkage analysis challenges on a distributed Grid environment. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The Human EST Ontology Explorer: a tissue-oriented visualisation system for ontologies distribution in human EST collections. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- The BreastCancerDB: a data integration approach for breast cancer research oriented to systems biology . (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Data management for SNP genotyping technologies (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Ancestry correction in genome-wide association studies using stratification methodologies (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- CYCLONET: An integrated Database on Cell Cycle regulation and carcinogenesis. (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
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- The role of High Performance Computing in Bioinformatics (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Modulo
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- Gestore di
- Descrizione di