Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)
- Type
- Modulo (Classe)
- Label
- Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002) (literal)
- Prodotto
- ProTailor: a Parallel Operator for Extremely Fast Shape Analysis in Bioinformatics Applications (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Parallelization of the SSAKE Genomics Application. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Integrating multi-omic features exploiting Chromosome Conformation Capture data (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A CUDA-based implementation of the SSAKE Genomics Application (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Molecular surface definition in Biophysical modelling of electrostatics problems (Abstract/Poster in convegno) (Prodotto della ricerca)
- Semi-Supervised Learning Techniques in Artificial Olfaction: A Novel Approach to Classification Problems and Drift Counteraction (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Codice
- INT.P02.008.002 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2017-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Abstract
- Lo scopo di questa ricerca è quello di progettare e realizzare algoritmi, metodi e strumenti per un uso efficace ed efficiente delle tecniche di calcolo ad alte prestazioni e di Grid compuitng per la bioinformatica. In particolare si è interessati all'utilizzo di strumenti di modellazione di dati 3D per applicazioni di molecular docking su architetture parallele e distribuite. La necessità di trattare grandi quantità di dati rappresenta uno degli aspetti più critici in questo contesto. La possibilità di usare algoritmi paralleli che sfruttano la memoria aggregata e la velocità di calcolo dei cluster, costituisce uno strumento fondamentale per lo sviluppo di applicazioni in grado di sfruttare la ricchezza di dati oggi disponibili. Una caratteristica delle componenti algoritmiche parallele che vengono sviluppate è la possibilità di assemblarle in modo flessibile, adattivo per soddisfare diverse esigenze di analisi in un ambiente distribuito dinamico. Un ulteriore aspetto che si affronta riguarda la progettazione e sviluppo di librerie parallele per l'image processing che siano grid aware e portabili su architetture eterogenee multicore. (literal)
- Nome
- Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (literal)
- Descrizione
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Descrizione del modulo "Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)" (Descrizione modulo)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)" (Descrizione collaborazioni)
- Modulo di
- Gestore
- ANDREA CLEMATIS (Persona)
Incoming links:
- Prodotto di
- Parallelization of the SSAKE Genomics Application. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- ProTailor: a Parallel Operator for Extremely Fast Shape Analysis in Bioinformatics Applications (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Molecular surface definition in Biophysical modelling of electrostatics problems (Abstract/Poster in convegno) (Prodotto della ricerca)
- A CUDA-based implementation of the SSAKE Genomics Application (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Semi-Supervised Learning Techniques in Artificial Olfaction: A Novel Approach to Classification Problems and Drift Counteraction (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Integrating multi-omic features exploiting Chromosome Conformation Capture data (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Modulo
- Gestore di
- ANDREA CLEMATIS (Persona)
- Istituto esecutore di
- Descrizione di
- Descrizione collaborazioni del modulo "Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione del modulo "Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)" (Descrizione modulo)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Algoritmi e strumenti per il calcolo ad alte prestazioni ed il Grid computing nel trattamento di dati 3D in ambito bioinformatico (INT.P02.008.002)" (Descrizione stato avanzamento attività)