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Algoritmi Statistici orientati al grid computing per la genetica (INT.P02.004.001)
- Type
- Label
- Algoritmi Statistici orientati al grid computing per la genetica (INT.P02.004.001) (literal)
- Prodotto
- Network-based survival analysis methods for pathway detection in cancer. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Identifying Regulatory Sites Using Neighborhood Species (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Bayesian inference for the analysis of multi-sample time-course microarray (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- BATS: Un software user-friendly per lanalisi Bayesiana di esperimenti di serie temporali con microarray. (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Understanding gene regulatory mechanisms by integrating ChIP-seq and RNA-seq data: statistical solutions to biological problems. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- BATS: A Bayesian user friendly Software for analyzing time series microarray experiments (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Analisi di serie temporali per microarray (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Massive-scale analysis of rRNA-depleted transcriptional landscape in human trisomy 21 (Abstract/Poster in convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1304)
- Estimation and Testing in time-course microarray experiments (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1201)
- Combining Replicates and Nearby Species Data: Methodologies, Examples and Results Interpretation (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Bioinformatics challenges and applications for NGS Sequencing (Abstract/Poster in convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1304)
- Multiple Clustering Solutions Analysis Through Lest-Square Consensus Algorithms (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- BATS: A user friendly Software for analyzing time series microarray experiments. (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Regulatory sequence annotation using cross gene expression data (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Selezione bayesiana delle variabili per l'identificazione di fattori di trascrizione in specie vicine (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Computational approaches for isoform detection and estimation: good and bad news (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Combining Replicates and Nearby Species Data: A Bayesian Approach (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Multiple Clustering Solutions Analysis Through Lest-Square Consensus Algorithms (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Bayesian models for the two-sample time-course microarray experiments (Rapporti tecnici, manuali, carte geologiche e tematiche e prodotti multimediali) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1715)
- Bayesian Methods for Time Course Microarray Analysis: From Genes' Detection to Clustering (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- International Journal of Biomedical Data Mining (Curatela) (Prodotto della ricerca)
- Impairment of circulating endothelial progenitors in Down syndrome (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- GAUSS-DIFFUSION PROCESSES FOR MODELING THE DYNAMICS OF A COUPLE OF INTERACTING NEURONS (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- The close relationship between the biosynthetic families of amino acids and the organisation of the genetic code (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Oil composition and genetic biodiversity of ancient and new olive (Olea europea L.) varieties and accessions of southern Italy (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Estimation and Testing in Time-course Microarray Experiments (Rapporti tecnici, manuali, carte geologiche e tematiche e prodotti multimediali) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1715)
- The footprint of metabolism in the organization of mammalian genomes (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Combining experimental evidences from replicates and nearby species data for annotating novel genomes (Rapporti tecnici, manuali, carte geologiche e tematiche e prodotti multimediali) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1715)
- Analysing RNA-Seq data with RNASeqGUI (Abstract in rivista) (Prodotto della ricerca)
- BATS: A Bayesian user friendly Software for analyzing time series microarray experiments. (Rapporti tecnici, manuali, carte geologiche e tematiche e prodotti multimediali) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1715)
- Genetically biodiverse potato cultivars grown on a suitable agricultural soil under compost amendment or mineral fertilization: Yield, quality, genetic and epigenetic variations, soil properties (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- RNA-seq: from computational challenges to biological insights (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Clustering Time-Course Microarray Data Using Functional Bayesian Infinite Mixture Model (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Bayesian methods for time course microarray analysis: from genes detection to clustering (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Beyond classical consensus clustering: the Least Squares approach to multiple solutions (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Massive-scale RNA-Seq analysis of non ribosomal transcriptome in human trisomy 21 (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Time-course whole-genome microarray analysis of estrogen effects on hormone-responsive breast cancer cells . (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Segmentation, classification and denoising of time series of images by a variational method (Rapporti tecnici, manuali, carte geologiche e tematiche e prodotti multimediali) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1715)
- Time-course whole-genome microarray analysis of estrogen effects on hormone-responsive breast cancer cells (Rapporti tecnici, manuali, carte geologiche e tematiche e prodotti multimediali) (Prodotto della ricerca)
- Discovering Typical Transcription-Factors Patterns in Gene Expression Levels of Mouse Embryonic Stem Cells by Instance-Based Classifiers (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- Statistical Approaches to Use a Model Organism for Regulatory Sequences Annotation of Newly Sequenced Species (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- L-Proline Induces a Mesenchymal-like Invasive Program in Embryonic Stem Cells by Remodeling H3K9 and H3K36 Methylation (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- RNASeqGUI: a GUI for analysing RNA-Seq data (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The rhizosphere competent entomopathogen Metarhizium anisopliae expresses a specific subset of genes in plant root exudate (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Optimal testing for additivity in multiple nonparametric regression (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- International Journal of Biomedical Data Mining (Curatela) (Prodotto della ricerca)
- Segmentation, Classification and Denoising of a Time Series Field by a Variational Method (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Pointwise optimality of Bayesian wavelet estimators (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Multiple clustering solutions analysis through least-squares consensus algorithms (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Bayesian models for the two-sample time-course microarray experiments (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Uncovering the complexity of transcriptomes with RNA-Seq (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Time-course whole-genome microarray analysis of estrogen effects on hormone-responsive breast cancer cells (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Time-course whole-genome microarray analysis of estrogen effects on hormone-responsive breast cancer cells (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- BATS: a Bayesian user-friendly software for Analyzing Time Series microarray experiments (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Statistical approaches for the analysis of RNA-Seq and ChIP-seq data and their integration (Abstract/Poster in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Statistical issues for combining replicates and nearby species data and different omics (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Analyzing the Whole Transcriptome by RNA-Seq Data: The Tip of the Iceberg (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Bioinformatics challenges and applications for NGS Sequencing (Abstract/Poster in convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1304)
- Analisi di soluzioni multiple di clustering mediante algoritmi di consenso Least-Square (Comunicazione a convegno) (Prodotto della ricerca)
- Analysis of the HBLA-B27 extended haplotype in Sardinia disclosed additional predisposing factors for Ankylosing Spondylitis. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Molecular dissection of a human chromatin disease ICF Syndrome (Abstract/Poster in convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1304)
- Identify regulatory sites using neighbourhood species, (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Combining experimental evidences from replicates and nearby species data for annotating novel genomes. (Contributo in volume (capitolo o saggio)) (Prodotto della ricerca)
- Bayesian Decision Theoretic Scale-Adaptive Estimation of a Log-Spectral Density (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Bayesian methods for time course microarray (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Bayesian variable selection, phylogenetic information, replicated experiments:a productive marriage for the identification of transcription factors (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- A SIMPLE ALGORITHM TO GENERATE FIRING TIMES FOR LEAKY INTEGRATE-AND-FIRE NEURONAL MODEL (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Bayesian Models for the two-sample time-course microarray experiments (Comunicazione a convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1303)
- Additive model selection (Abstract/Comunicazione in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1305)
- AnaLysis of Expression on human chromosome 21, ALE-HSA21: a pilot integrated web resource (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Wavelet density estimation for weighted data (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- RNA-seq analysis of TBX1-induced transcriptional changes in human endothelial cells (Abstract/Poster in convegno) (Prodotto della ricerca)
- Genome wide analysis of epigenetics alterations due to DNMT3B mutation in ICF Syndrome (Abstract/Poster in convegno) (Prodotto della ricerca)
- Massive-scale RNA-Seq experiments in human genetic diseases (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- Epigenomic and transcriptional effects of Dnmt3b mutations in human ICF syndrome derived B cell lines (Abstract/Poster in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1302)
- A Bayesian approach to estimation and testing in time-course microarray experiments (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Codice
- INT.P02.004.001 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2015-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Abstract
- La genetica è stata una scienza in grande evoluzione nelle ultimi anni ed è tuttora in fase di grande e promettente espansione verso nuove scoperte che possono aiutare nella comprensione, cura e prevenzione di molte patologie. Un ruolo molto importante in questa direzione può essere giocato dalla matematica e dalla statistica, che possono fornire modelli e metodi per meglio spiegare/analizzare dati ed fenomeni in esame, e dall'informatica che può fornire gli strumenti hardware e software indispensabili per manipolare la grande quantità di dati coinvolta. La presente commessa si propone di sviluppare metodologie innovative ed efficienti per l'analisi di dati di genetica e di implementare il relativo software su architetture di calcolo moderne come cluster di workstations o grid. Particolare attenzione verrà posta nello sviluppo di metodologie computazionali innovative per l'analisi di moderni strumenti di indagine genetica come le moderne piattaforme per la 'next generation sequencing'. Verrà anche curata la diffusione dei risultati all'interno della comunità scientifica e la formazione di personale esperto in bioinformatica. (literal)
- Nome
- Algoritmi Statistici orientati al grid computing per la genetica (literal)
- Descrizione
- Modulo di
- Gestore
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- Prodotto di
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