Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)
- Type
- Modulo (Classe)
- Label
- Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003) (literal)
- Prodotto
- Structure and stability of amyloid-like aggregates investigated by molecular dynamics (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Structure of amyloid-like fibers: molecular dynamics analyses complementing crystallographic data (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- NMR structure and CD titration with metal cations of human prion a2-helix-related peptides (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Structure, dynamics and stability of assemblies of the human prion fragment SNQNNF: insights into prion fiber structure. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Prion and water: Tight and dynamical hydration sites have a key role in structural stability. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Insight into Ribonuclease A Domain Swapping by Molecular Dynamics Unfolding Simulations (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Conformational diseases and structure-toxicity relationships: lessons from prion-derived peptides (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Insights into stability and toxicity of amyloid-like oligomers by replica exchange molecular dynamics analyses. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix 2binding peptide constructs (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Stability of single sheet GNNQQNY aggregates analyzed by replica exchange molecular dynamics: antiparallel versus parallel association (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- A new synthetic route to gamma-mercaptomethyl PNA monomers (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Molecular dynamics analyses of the steric zipper motif: a new twist in the never-ending story of amyloid fiber structure (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Water molecules as structural determinants among prions of low sequence identity. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Human prion a2-helix-related peptides: have metal cations a role in the misfunction of the whole protein? (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Assessing the acid-base and conformational properties of histidine residues in human prion protein(125-228) by means of pK_a calculations and molecular dynamics simulations. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Effect of salts on the structural behavior of hPrP alpha2-helix-derived analogues: the counterion perspective (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Recombinant amyloidogenic domain of ApoA-I: Analysis of its fibrillogenic potential (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Molecular dynamics analyses of the steric zipper motif formed by amyloidogenic peptides. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Molecular dynamics analyses of peptides forming amyloid-like fibrils (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix 2binding peptide constructs (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Abeta(25-35) and its C- and/or N-blocked derivatives: copper driven structural features and neurotoxicity (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Open interface and large quaternary structure movements in 3D domain swapped proteins: insights from molecular dynamics simulations of the C-terminal swapped dimer of ribonuclease A (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Does tetracycline bind helix 2 of prion? An integrated spectroscopical and computational study of the interaction between the antibiotic and alpha helix 2 human prion protein fragments (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Unveiling analogies between amyloid-based diseases and serpinopathies: an integrated computational/experimental approach (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Prion Protein helix 2 conformational properties: implications for full length protein folding and stability (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Involvement of the human prion protein helix-2-like fragment PrP[173-195] in fibril formation (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix2-binding peptide constructs (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The conformational landscape of the human prion protein C-globular á2-helix: role of metal cations. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Equilibri di formazione tra cationi metallici e proteina prionica: studio dellelica-2 del dominio C-globulare (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Electron transfer to flat peptides (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Fluorimetric investigation and Molecular Dynamics simulation on interactions between Prion Protein Helix 2 and Tetracycline (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Peptide Fragment Approach to Prion Misfolding: The Alpha-2 Domain (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A thermodynamic approach to the conformational preferences of the 180-195 segment derived from the human prion protein a 2-helix (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- A new Nerve Growth Factor (NGF)-mimetic peptide active on neuropathic pain in rats. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Fluorimetric investigation and molecular dynamics simulation on interaction between prion protein helix: And tetracycline (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Structural characterization of a neurotoxic threonine-rich peptide corresponding to the human prion protein a2-helical 180-195 segment, and comparison with full-length a2-helix-derived peptides. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Expression and characterization of recombinant apolipoprotein A-I (Apo A-I) fibrillogenic domain: first steps toward a structural and functional definition of ApoA-I associated amyloidosis (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Role of the conformational versatility of the neurotrophin N-terminal regions in their recognition by Trk receptors (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix 2binding peptide constructs (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Dalle fibre amiloidi agli oligomeri tossici: nuovi modelli ottenuti da studi di dinamica molecolare. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Effects of disease-associated mutations on the aggregation process of the 93-residue N-terminal fragment of human apolipoprotein A-I XII International Symposium on Amyloidosis (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- The human prion protein a2 helix: a thermodynamic study of its conformational preferences. (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Effects of the known pathogenic mutations on theaggregation pathway of the amyloidogenic peptide of apolipoprotein A-I (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- The prion protein: structural features and related toxic peptides. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- The effect of the osmolyte trimethylamine N-oxide on the stability of the prion protein at low pH. (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Codice
- PM.P01.004.003 (literal)
- Anno di chiusura previsto
- 2014-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Istituto esecutore
- Istituto di biostrutture e bioimmagini (IBB) (Istituto)
- Primo anno di attività
- 2006-01-01T00:00:00+01:00 (literal)
- Abstract
- Il modulo propone le attività in corso di svolgimento nell'ambito di un progetto FIRB dal titolo \"Protein folding and aggregation metals and biomolecules in neurodegenerative diseases\" ed un progetto MERIT che termina nel 2014. Le attività di ricerca sono focalizzate sullo studio di sistemi peptidici modello con tecniche NMR, CD, fluorescenza e possibilmente RaggiX per investigare i meccanismi molecolari di riarrangiamento conformazionale che hanno luogo in particolari proteine e che contribuiscono all'insorgenza di malattie note come malattie conformazionali. In particolare si studiano gli effetti prodotti da metalli o altri fattori su queste proteine ed il loro coinvolgimento in meccanismi fisiologici e patologici. I sistemi modello oggetto di studio sono costituiti principalmente da peptidi derivati dalla proteina prionica e dal peptide B-Amiloide. I peptidi sono preparati per via chimica e ne vengono studiate le proprietà conformazionali con varie tecniche e la funzionalità in termini di citotossicità su vari sistemi cellulari o in vivo oltre che di associazione/binding con metalli e piccole molecole organiche modulatori dell'attività delle proteine coinvolte (literal)
- Nome
- Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (literal)
- Descrizione
- Descrizione del modulo "Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)" (Descrizione modulo)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)" (Descrizione stato avanzamento attività)
- Modulo di
- Gestore
- MENOTTI RUVO (Persona)
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- Prodotto di
- Prion Protein helix 2 conformational properties: implications for full length protein folding and stability (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Involvement of the human prion protein helix-2-like fragment PrP[173-195] in fibril formation (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
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- Fluorimetric investigation and Molecular Dynamics simulation on interactions between Prion Protein Helix 2 and Tetracycline (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix 2binding peptide constructs (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Molecular dynamics analyses of the steric zipper motif formed by amyloidogenic peptides. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
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- Unveiling analogies between amyloid-based diseases and serpinopathies: an integrated computational/experimental approach (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- The conformational landscape of the human prion protein C-globular á2-helix: role of metal cations. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Equilibri di formazione tra cationi metallici e proteina prionica: studio dellelica-2 del dominio C-globulare (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Electron transfer to flat peptides (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
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- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix 2binding peptide constructs (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
- Dalle fibre amiloidi agli oligomeri tossici: nuovi modelli ottenuti da studi di dinamica molecolare. (Contributo in atti di convegno) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1301)
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- Insight into Ribonuclease A Domain Swapping by Molecular Dynamics Unfolding Simulations (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
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- NMR structure and CD titration with metal cations of human prion a2-helix-related peptides (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
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- Spectroscopic analysis of synthetic PrP helix 2binding peptide constructs (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Molecular dynamics analyses of the steric zipper motif: a new twist in the never-ending story of amyloid fiber structure (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Human prion a2-helix-related peptides: have metal cations a role in the misfunction of the whole protein? (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Structure and stability of amyloid-like aggregates investigated by molecular dynamics (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Structure of amyloid-like fibers: molecular dynamics analyses complementing crystallographic data (Contributo in atti di convegno) (Prodotto della ricerca)
- Conformational diseases and structure-toxicity relationships: lessons from prion-derived peptides (Articolo in rivista) (http://www.cnr.it/ontology/cnr/individuo/prodotto/TIPO1101)
- Effects of the known pathogenic mutations on theaggregation pathway of the amyloidogenic peptide of apolipoprotein A-I (Articolo in rivista) (Prodotto della ricerca)
- Modulo
- Istituto esecutore di
- Istituto di biostrutture e bioimmagini (IBB) (Istituto)
- Gestore di
- MENOTTI RUVO (Persona)
- Descrizione di
- Descrizione del modulo "Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)" (Descrizione modulo)
- Descrizione collaborazioni del modulo "Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)" (Descrizione collaborazioni)
- Descrizione dello stato di avanzamento delle attività del modulo "Modelli molecolari per lo studio di malattie conformazionali (PM.P01.004.003)" (Descrizione stato avanzamento attività)