Descrizione previsione attività della commessa "Biologia Computazionale (ME.P07.005)"

Type
Label
  • Descrizione previsione attività della commessa "Biologia Computazionale (ME.P07.005)" (literal)
Iniziative per acquisizione entrate
  • L'attività di \"fund raising\" è costante e continua. Verranno presentate specifiche richieste di finanziamenti per l'avvio dei nuovi progetti di carattere bioinformatico. (literal)
Punti critici
  • La commessa possiede competenze di genetica, biologia molecolare, epidemiologia, statistica e di biologia dei sistemi, ma dovrà cercare di aumentare la forza lavoro nel campo della bioinformatica con nuovo personale e con nuove collaborazioni. Inoltre sarà necessario predisporre percorsi formativi per creare nuove figure professionali capaci di integrare le competenze acquisite nei settori della modellistica matematica, della simulazione e della biologia molecolare e di operare traendo vantaggio dall'interdisciplinarità del contesto scientifico-formativo. (literal)
Attività da svolgere
  • I progetti di ricerca ad oggi in corso verranno portati avanti nel prossimo biennio. In particolare: (1) proseguiranno gli studi di biologia dei sistemi mirati all'elaborazione di modelli utili alla comprensione dei meccanismi evolutivi e patologici. Utilizzando i dati disponibili in letteratura e il modello dell'iperciclo metabolico si cercherà di sviluppare un modello generale delle malattie complesse e di confermare la sua validità mediante l'analisi di dati genetici; (2) verrà proseguito il lavoro di sviluppo ed implementazione web del nuovo strumento bioinformatico da noi sviluppato, CorrelaGenes (http://www.igm.cnr.it/cabgen/web-correlagenes0/). Lo strumento è stato reso accessibile alla comunità scientifica di recente e i risultati con esso ottenuti saranno oggetto di validazione molecolare. (3) verrà ampliata la capacità di analisi di dati di Next Generation Sequencing attraverso la creazione di una pipeline d'analisi principalmente mirata allo studio degli eventi di splicing. Verrà inoltre implementata una pipeline per l'analisi di dati di CHIPseq recentemente disponibili in Istituto. (4) verrà ampliato un nuovo progetto di ricerca, recentemente avviato, riguardante lo studio dei profili d'espressione dei ncRNAs in cellule normali o patologiche (5) verrà proseguito il lavoro di organizzazione e gestione della rete informatica dell'Istituto e di progettazione e programmazione web. (6) Nell'ambito dello studio epidemiologico sulla sindrome metabolica (SM) in Ogliastra, in collaborazione con l'IGP di Sassari, i risultati dell'esperimento sulle molecole pro-infiammatorie sono incoraggianti e suggeriscono un indagine più approfondita. Pertanto si propone di impostare un nuovo esperimento dosando le 3 molecole risultate significativamente diverse nei paesi: la chemochina RANTES, l'eotaxin e l'interluchina IL-17. Il nuovo esperimento prevede 4 paesi del'Ogliastra (Loceri, Baunei, Urzulei e Talana) considerando per ogni paese 40 individui affetti da sindrome metabolica e 40 individui di controllo e utilizzando il plasma di soggetti singoli affetti o meno da SM, senza suddivisione per sesso ed età. Tale esperimento pilota permetterà di confermare i dati preliminari e di valutare la possibilità di estendere l'analisi ad una popolazione più ampia L'obiettivo principale della commessa è quello di sviluppare, in seno all'istituto di Genetica Molecolare del CNR di Pavia, competenze di tipo bioinformatico e di biologia computazionale per l'analisi di dati provenienti da approcci \"genome-wide\". L'idea è quella di creare un centro di riferimento che sviluppi propri progetti e che possa essere di supporto alle attività di ricerca di altri gruppi. In questo contesto, la commessa intende sviluppare nuovi progetti e approcci metodologici che prevedano la partecipazione di tutti i ricercatori e tecnologi afferenti e collaborazioni interdisciplinari allo scopo di sviluppare nuovi approcci computazionali e di \"data mining\" caratterizzati dall'integrazione di competenze diverse. In questo contesto è già stato attivato un accordo di cooperazione con i ricercatori dell'IMATI-CNR di Pavia per lo sviluppo di progetti di ricerca che prevedano l'applicazione di metodologie matematiche a tematiche di biologia e genetica molecolare e di biomedicina che abbiano come valore aggiunto l'utilizzo di approcci interdisciplinari basati sulle specifiche competenze dei ricercatori e tecnologi dei due Istituti. (literal)
Risultati attesi
  • Le linee di ricerca descritte nonostante attivate di recente hanno portato ad una buona produzione scientifica pubblicata su riviste internazionali. Di maggior rilievo comunque rimane il contributo innovativo che la commessa ha contribuito a realizzare all'interno dell'Istituto e che continuerà ad essere oggetto di investimento. (literal)
Descrizione di

Incoming links:


Descrizione
data.CNR.it