Descrizione previsione attività della commessa "Struttura e dinamica di proteine (MD.P01.008)"

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  • Descrizione previsione attività della commessa "Struttura e dinamica di proteine (MD.P01.008)" (literal)
Iniziative per acquisizione entrate
  • Stiamo sviluppando una nuova collaborazione con CNR-ISC e CNR-IVALSA riguardante gli effetti di nanoparticelle ablate sullo sviluppo di piante di olivo. Su questo progetto intendiamo presentare una richiesta di finanziamento alla Regione Toscana. (literal)
Punti critici
  • Come già più volte segnalato i punti critici sono: a) la mancanza di finanziamenti, con il conseguente rallentamento dell'attività e l'impossibilità di acquisire nuove apparecchiature sia in sostituzione di quelle divenute obsolete, sia per intraprendere linee di ricerca nuove; b) la ricerca di finanziamenti, spesso non coronata da successo, distoglie tempo ed energie dal lavoro di ricerca; c) l'assenza di ricercatori giovani favorisce la fossilizzazione di tecniche e idee, poiché viene meno l'apporto di nuove competenze e conoscenze, indispensabile per lo sviluppo di una ricerca stimolante e innovativa. (literal)
Attività da svolgere
  • - Lo studio, mediante tecniche proteomiche (2D Elettroforesi), degli effetti di nanoparticelle antropiche su organismi viventi sarà esteso ad altre nanoparticelle, diverse dalle quantum dots, quali nanoparticelle di ossidi e metalli. Oltre alle alghe marine, saranno investigati altri sistemi del mondo vegetale. Lo scopo della ricerca è valutare l'eventuale tossicità delle nanoparticelle studiate, individuare marker specifici di esposizione ed investigare i meccanismi molecolari delle risposte di adattamento. - Il fosforimetro, costruito in questo laboratorio, sarà potenziato introducendo un sistema per la misura di tempi di vita di fluorescenza nella cella ad alta pressione (pressioni fino a 7 kbar). Tale upgrading permetterà di introdurre un ulteriore parametro, accanto a tempo di vita di fosforescenza, centro di massa spettrale e intensità di fluorescenza, nella caratterizzazione della risposta di proteine alla pressione. La realizzazione di questo progetto potrà avvenire solo se riusciremo ad ottenere finanziamenti adeguati. - Proseguirà lo studio della dinamica del ciclo del carbonio nel Mediterraneo ed in particolare nelle acque costiere alla foce del fiume Arno. Verranno misurate le proprietà ottiche (assorbimento, fluorescenza e fosforescenza) della sostanza organica disciolta per avere informazioni indirette sulla sua composizione chimica e alcune attività enzimatiche extracellulari (galattosidasi, proteasi e fosfatasi) al fine di caratterizzare la componente microbica di questa area. - La migliore risoluzione spaziale e temporale nell'acquisizione delle immagini permetterà di studiare con maggior dettaglio la via di fototrasduzione di H. salinarum consentendo di ottenere maggiore informazione sull'interazione tra le proteine fotorecettrici sia tra loro all'interno della membrana cellulare sia con le proteine citosoliche che lungo la via di trasduzione trasmettono il segnale luminoso. Si prevede di continuare lo studio delle proprietà fisico-chimiche delle proteine fotorecettrici, la loro espressione in funzione dei parametri di coltura, mediante metodologie proteomiche. - Dando seguito al disegno sperimentale messo a punto con l'ICB-CNR di Napoli, si cercherà di identificare in F. salina i metaboliti differenzialmente espressi in tempi medi dall'irraggiamento (12-24h), nel tentativo di individuare gli intermedi della catena di trasduzione per la radiazione UV. Inoltre, sfruttando dati di trascrittomica di F. salina, recentemente resi disponibili da un consorzio di sequenziamento americano, si cercheranno trascritti molecolari che mostrino omologia per recettori della luce o tipologia di promotori luce-inducibili. La collaborazione al progetto internazionale \"1000 genomes of yeast\" permetterà di avere accesso a un database genomico molto più grande dell'attuale, quindi si prevede di poter effettuare un'analisi più completa degli elementi mobili nel lievito. - Continuerà lo studio spettroscopico e di microscopia confocale dei pigmenti endogeni del ciliato eterotrico B. japonicum. Si prevede inoltre di realizzare l'analisi proteica mono e bidimensionale della forma WT e del mutante albino di B. japonicum. - In collaborazione con Nano-CNR, NEST-SNS di Pisa e IBF-Palermo proseguirà lo studio spettroscopico e di microscopia confocale degli effetti di composti curcuminoidi sul processo di aggregazione del peptide beta amiloide implicato nel morbo di Alzheimer. In particolare, saranno valutati gli effetti di composti curcuminoidi di nuova sintesi sia sulla cinetica di aggregazione del peptide beta amiloide sia sulle proprietà neurotossiche dello stesso peptide a livello della membrana cellulare. - Nell'ambito delle attività di divulgazione scientifica, essendo il 2015 \"L'anno internazionale della luce\" particolare attenzione verrà dedicata ai fenomeni biologici innescati/modulati dalla luce. Si prevede di organizzare eventi e/o seminari focalizzati sulla complessa interazione tra la luce e i microrganismi. (literal)
Risultati attesi
  • Pubblicazione di articoli scientifici (literal)
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